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ggplot2で作成されたプロットの下にデータに関する情報を表示しようとしています。プロットの X 軸座標を使用して N 変数をプロットしたいのですが、Y 座標は画面の下部から 10% である必要があります。実際、目的の Y 座標は、y_pos 変数としてデータ フレームに既に含まれています。

ggplot2を使用して 3 つのアプローチを考えることができます。

1) 実際のプロットの下に空のプロットを作成し、同じスケールを使用してから、geom_text を使用して空白のプロットにデータをプロットします。このアプローチは機能しますが、非常に複雑です。

2)geom_textデータをプロットするために使用しますが、何らかの方法で y 座標を画面のパーセント (10%) として使用します。これにより、数値がプロットの下に表示されます。適切な構文がわかりません。

3) grid.text を使用してテキストを表示します。画面の下部から 10% に簡単に設定できますが、X 座標をプロットに合わせて設定する方法がわかりません。grconvert を使用して最初の X 位置をキャプチャしようとしましたが、それも機能しませんでした。

以下は、ダミー データを使用した基本的なプロットです。

graphics.off()      # close graphics windows   

library(car)
library(ggplot2)  #load ggplot
library(gridExtra) #load Grid
library(RGraphics) # support of the "R graphics" book, on CRAN

#create dummy data
test= data.frame(
  Group = c("A", "B", "A","B", "A", "B"), 
  x = c(1 ,1,2,2,3,3 ),
  y = c(33,25,27,36,43,25),
  n=c(71,55,65,58,65,58),
  y_pos=c(9,6,9,6,9,6)
  )

#create ggplot
p1 <- qplot(x, y, data=test, colour=Group) +
  ylab("Mean change from baseline") + 
  geom_line()+
  scale_x_continuous("Weeks", breaks=seq(-1,3, by = 1) ) +
  opts( 
        legend.position=c(.1,0.9))

#display plot
p1

以下の変更された gplot は被験者の数を表示しますが、それらはプロット内に表示されます。Yスケールを強制的に拡張します。これらの数値をプロットの下に表示したいと思います。

    p1 <- qplot(x, y, data=test, colour=Group) +
  ylab("Mean change from baseline") + 
  geom_line()+
  scale_x_continuous("Weeks", breaks=seq(-1,3, by = 1) ) +
  opts( plot.margin = unit(c(0,2,2,1), "lines"),
        legend.position=c(.1,0.9))+
  geom_text(data = test,aes(x=x,y=y_pos,label=n))

p1

数値を表示する別の方法では、実際のプロットの下にダミー プロットを作成します。コードは次のとおりです。

graphics.off()      # close graphics windows   

library(car)
library(ggplot2)  #load ggplot
library(gridExtra) #load Grid
library(RGraphics) # support of the "R graphics" book, on CRAN

#create dummy data
test= data.frame(
  group = c("A", "B", "A","B", "A", "B"), 
  x = c(1 ,1,2,2,3,3 ),
  y = c(33,25,27,36,43,25),
  n=c(71,55,65,58,65,58),
  y_pos=c(15,6,15,6,15,6)
  )


p1 <- qplot(x, y, data=test, colour=group) +
  ylab("Mean change from baseline") + 
  opts(plot.margin = unit(c(1,2,-1,1), "lines")) +
  geom_line()+
  scale_x_continuous("Weeks", breaks=seq(-1,3, by = 1) ) +
  opts(legend.position="bottom",
       legend.title=theme_blank(),
       title.text="Line plot using GGPLOT") 
p1

p2 <- qplot(x, y, data=test, geom="blank")+
  ylab(" ")+
  opts(     plot.margin = unit(c(0,2,-2,1), "lines"),
            axis.line = theme_blank(), 
            axis.ticks = theme_segment(colour = "white"),           
            axis.text.x=theme_text(angle=-90,colour="white"),
            axis.text.y=theme_text(angle=-90,colour="white"),
            panel.background = theme_rect(fill = "transparent",colour = NA), 
            panel.grid.minor = theme_blank(),      
            panel.grid.major = theme_blank()
            )+
  geom_text(data = test,aes(x=x,y=y_pos,label=n)) 
p2

grid.arrange(p1, p2, heights = c(8.5, 1.5),             nrow=2 )

ただし、これは非常に複雑で、さまざまなデータに合わせて変更するのは困難です。理想的には、Y 座標を画面のパーセントとして渡すことができるようにしたいと考えています。

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4 に答える 4

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現在のバージョン (>2.1) には+ labs(caption = "text")、プロットの下に注釈を表示する があります。これはテーマ化可能です (フォント プロパティ、... 左/右揃え)。例については、 https://github.com/hadley/ggplot2/pull/1582を参照してください。

于 2016-03-16T13:01:45.327 に答える
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Edited optsは廃止され、theme;に置き換えられました。element_blankを置き換えましたtheme_blank。のggtitle()代わりに使用されます。opts(title = ...

サンディ - どうもありがとう!!!! これはまさに私が望むことです。geom.text または geom.annotate でクリッピングを制御できればと思います。

他の誰かが興味を持っている場合は、次のプログラムをまとめました。

 rm(list = ls())     # clear objects  
 graphics.off()      # close graphics windows   

library(ggplot2)
library(gridExtra)

#create dummy data
test= data.frame(
  group = c("Group 1", "Group 1", "Group 1","Group 2", "Group 2", "Group 2"), 
  x = c(1 ,2,3,1,2,3 ),
  y = c(33,25,27,36,23,25),
  n=c(71,55,65,58,65,58),
  ypos=c(18,18,18,17,17,17)

  )


p1 <- qplot(x=x, y=y, data=test, colour=group) +
  ylab("Mean change from baseline") + 
  theme(plot.margin = unit(c(1,3,8,1), "lines")) +
  geom_line()+
  scale_x_continuous("Visits", breaks=seq(-1,3) ) +
  theme(legend.position="bottom",
       legend.title=element_blank())+
   ggtitle("Line plot") 


# Create the textGrobs 
for (ii in 1:nrow(test))
{
  #display numbers at each visit
  p1=p1+ annotation_custom(grob = textGrob(test$n[ii]),  
                           xmin = test$x[ii], 
                           xmax = test$x[ii], 
                           ymin = test$ypos[ii], 
                           ymax = test$ypos[ii])

    #display group text
    if (ii %in% c(1,4)) #there is probably a better way 
      {
    p1=p1+ annotation_custom(grob = textGrob(test$group[ii]),  
                             xmin = 0.85, 
                             xmax = 0.85, 
                             ymin = test$ypos[ii], 
                             ymax = test$ypos[ii])
    }

  }




  # Code to override clipping
  gt <- ggplot_gtable(ggplot_build(p1))
  gt$layout$clip[gt$layout$name=="panel"] <- "off"
  grid.draw(gt)

ここに画像の説明を入力

于 2012-05-03T02:59:38.617 に答える
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更新され opts()たものはに置き換えられましたtheme()

以下のコードでは、ベースプロットが描画され、プロットの下部にマージンが広くなっています。textGrobが作成され、annotation_custom()を使用してプロットに挿入されます。テキストがプロットパネルの外側にあるため表示されないことを除いて、出力はパネルにクリップされます。しかし、ここからbaptisteのコードを使用すると、クリッピングをオーバーライドできます。位置はデータ単位であり、両方のテキストラベルが中央に配置されます。

library(ggplot2)
library(grid)

# Base plot
df = data.frame(x=seq(1:10), y = seq(1:10))
p = ggplot(data = df, aes(x = x, y = y)) + geom_point() + ylim(0,10) +
    theme(plot.margin = unit(c(1,1,3,1), "cm"))
p

# Create the textGrobs
Text1 = textGrob(paste("Largest x-value is", round(max(df$x), 2), sep = " "))
Text2 = textGrob(paste("Mean = ", mean(df$x), sep = ""))

p1 = p + annotation_custom(grob = Text1,  xmin = 4, xmax = 4, ymin = -3, ymax = -3) +
        annotation_custom(grob = Text2,  xmin = 8, xmax = 8, ymin = -3, ymax = -3)
p1

# Code to override clipping
gt <- ggplotGrob(p1)
gt$layout$clip[gt$layout$name=="panel"] <- "off"
grid.draw(gt)

ここに画像の説明を入力してください

または、grid関数を使用してラベルを作成および配置します。

p
grid.text((paste("Largest x-value is", max(df$x), sep = " ")),
   x = unit(.2, "npc"), y = unit(.1, "npc"), just = c("left", "bottom"), 
   gp = gpar(fontface = "bold", fontsize = 18, col = "blue"))

ここに画像の説明を入力してください

編集 または、gtable関数を使用してテキストgrobを追加します。

library(ggplot2)
library(grid)
library(gtable)

# Base plot
df = data.frame(x=seq(1:10), y = seq(1:10))
p = ggplot(data = df, aes(x = x, y = y)) + geom_point() + ylim(0,10) 

# Construct the text grob
lab = textGrob((paste("Largest x-value is", max(df$x), sep = " ")),
   x = unit(.1, "npc"), just = c("left"), 
   gp = gpar(fontface = "bold", fontsize = 18, col = "blue"))


gp = ggplotGrob(p)

# Add a row below the 2nd from the bottom
gp = gtable_add_rows(gp, unit(2, "grobheight", lab), -2)

# Add 'lab' grob to that row, under the plot panel
gp = gtable_add_grob(gp, lab, t = -2, l = gp$layout[gp$layout$name == "panel",]$l)

grid.newpage()
grid.draw(gp)

ここに画像の説明を入力してください

于 2012-04-27T07:46:53.700 に答える
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実際、最良の答えと最も簡単な解決策は、 Cowplot パッケージを使用することです。

バージョン 0.5.0 の cowplot パッケージ (CRAN 上) は、add_sub 関数を使用して ggplot2 字幕を処理します。

次のように使用します。

  diamondsCubed <-ggplot(aes(carat, price), data = diamonds) + 
  geom_point() + 
  scale_x_continuous(trans = cuberoot_trans(), limits = c(0.2, 3),
                     breaks = c(0.2, 0.5, 1, 2, 3)) + 
  scale_y_continuous(trans = log10_trans(), limits = c(350, 15000),
                     breaks = c(350, 1000, 5000, 10000, 15000)) +
  ggtitle('Price log10 by Cube-Root of Carat') +
  theme_xkcd()


  ggdraw(add_sub(diamondsCubed, "This is an annotation.\nAnnotations can span multiple lines."))
于 2016-01-04T02:10:18.347 に答える