わかりましたので、Eclipse adtをバージョン17に更新すると、このエラーが発生します
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): FATAL EXCEPTION: main
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): java.lang.RuntimeException: Unable to instantiate activity ComponentInfo{com.galeola.agentis/com.galeola.agentis.activity.GestionaleActivity}: java.lang.ClassNotFoundException: com.galeola.agentis.activity.GestionaleActivity in loader dalvik.system.PathClassLoader[/system/framework/com.google.android.maps.jar:/data/app/com.galeola.agentis-1.apk]
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at android.app.ActivityThread.performLaunchActivity(ActivityThread.java:1742)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at android.app.ActivityThread.handleLaunchActivity(ActivityThread.java:1834)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at android.app.ActivityThread.access$500(ActivityThread.java:122)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at android.app.ActivityThread$H.handleMessage(ActivityThread.java:1027)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at android.os.Handler.dispatchMessage(Handler.java:99)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at android.os.Looper.loop(Looper.java:132)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at android.app.ActivityThread.main(ActivityThread.java:4126)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at java.lang.reflect.Method.invokeNative(Native Method)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:491)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at com.android.internal.os.ZygoteInit$MethodAndArgsCaller.run(ZygoteInit.java:844)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at com.android.internal.os.ZygoteInit.main(ZygoteInit.java:602)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at dalvik.system.NativeStart.main(Native Method)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: com.galeola.agentis.activity.GestionaleActivity in loader dalvik.system.PathClassLoader[/system/framework/com.google.android.maps.jar:/data/app/com.galeola.agentis-1.apk]
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at dalvik.system.PathClassLoader.findClass(PathClassLoader.java:251)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:540)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:500)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at android.app.Instrumentation.newActivity(Instrumentation.java:1022)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): at android.app.ActivityThread.performLaunchActivity(ActivityThread.java:1733)
04-05 12:28:55.810: E/AndroidRuntime(5470): ... 11 more
ただし、ライブラリを /libs に移動するとアプリケーションを起動できますが、ライブラリが /libs にあると javadoc と javasources が機能しなくなり、/libs にない場合は javadoc と javasources が機能するため、理由がわかりません。