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23サンプルの発現データ（約500遺伝子）に対して、監視された自己組織化マップを実行しようとしています。23のサンプルは4つのグループに分けられます。これら4つのグループで同様の発現パターンを持つ遺伝子のマップを取得したいと思います。

xyfパッケージの機能Kohonenを監視モデリングに使用する場合、

data.xyf<-xyf(data,Y=annotation)

次のエラーが発生します。

sample（1：nd、ng、replace = FALSE）のエラー：'replace = FALSE'の場合、母集団よりも大きいサンプルを取得できません

関数のどこを呼び出すべきかわかりませんreplace=T。パッケージマニュアルには、このトピックに関する情報はありません。

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どうやら観測よりも多くのセルがあります。ドキュメントの例のように、グリッドの次元を減らすことができます (デフォルトは 8*6) ?xyf。

xyf(data, Y=annotation, grid=somgrid(3,2))
于 2012-04-08T09:32:22.400 に答える