配列間に直接 1:1 の一致があると仮定すると、次のようにそれらの 1 つを単純にループできます。
foreach ($name as $key => $value) {
  $name_value = mysql_real_escape_string($value);
  $url_value = mysql_real_escape_string($url[$key]);
  // Addendum: If there was a third array, just use `$key` as the array key
  // same as done with $url[$key]
  $thrid_value = mysql_real_escape_string($third_arr[$key]);
  $result = mysql_query("INSERT INTO tbl_websites (site_name, site_url, third_value) VALUES ('$name_value', '$url_value', '$third_value')");
}
idこれは、が自動インクリメント値であることを前提としています。簡単にするために、mysql_query()ここで関数を使用しました。ただし、代わりに PDO などの API を介してプリペアド ステートメントを使用することをお勧めします。配列からそれらを取得するプロセスは同じです。
PDO のバージョン (既に で接続が確立されているものとします$db):
foreach ($name as $key => $value) {   
  $stmt = $db->prepare("INSERT INTO tbl_websites (site_name, site_url) VALUES (:name, :url)");
  $stmt->execute(array(':name' => $name_value, ':url' => $url_value));
}
上記のコードにはエラー チェックが含まれていません。PDO ステートメントを使用したエラー チェックの例については、PDO マニュアルを参照してください。try/catchこれは、例外ブロックまたは PHP 警告を使用して行うことができます。