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基本的に私は上記が必要です。私はグーグルをトロールしましたが、これを実装する方法を見つけることができません。

この関数はhttp://www.guwi17.de/ublas/examples/で見つけましたが、遅すぎます。私はMATLABのルーチンに従って独自のパデ近似を作成しましたが、リンクにあるものよりもわずかに高速でした。

私を驚かせるのは、Mathematicaが行列指数をどれだけ速く計算できるかということです（行列がtridiagであるかどうかはわかりません）。

誰かが助けることができますか？

編集：これが私が思いついたものです、コメントはありますか？将来の読者に役立つことを願っています

私はしばらくの間c++を使用していなかったので、以下のコードは少しごちゃごちゃした/遅いかもしれません。改善が見られたら教えてください。

//Program will compute the matrix exponential expm( i gA ). where i = sqrt(-1) and gA is a matrix

#include <iostream>
#include <gsl/gsl_complex.h>
#include <gsl/gsl_complex_math.h>
#include <gsl/gsl_matrix.h>
#include <gsl/gsl_linalg.h>
#include <gsl/gsl_blas.h>


int main() {

    int n = 100;

    unsigned i = 0;
    unsigned j = 0;

    gsl_complex img = gsl_complex_rect (0.,1.);

    gsl_matrix * gA = gsl_matrix_alloc (n, n);


//Set gA:       
    for ( i = 0; i<n; i++) {
        for ( j = 0; j<=i; j++) {
            if( i == j ) {
                if( i == 0 || i == n-1 ) {
                    gsl_matrix_set (gA, i, j, 1.);
                } else {
                    gsl_matrix_set (gA, i, j, 2.);
                }
            } else if( j == i-1 ) {
                gsl_matrix_set (gA, i, j, 1.);
                gsl_matrix_set (gA, j, i, 1.);
            } else {
                gsl_matrix_set (gA, i, j, 0.);
                gsl_matrix_set (gA, j, i, 0.);
        }
    }
}


//get SVD of gA 
    gsl_matrix * gA_t = gsl_matrix_alloc (n, n);
    gsl_matrix_transpose_memcpy (gA_t, gA);                 

    gsl_matrix * U = gsl_matrix_alloc (n, n);
    gsl_matrix * V= gsl_matrix_alloc (n, n);
    gsl_vector * S = gsl_vector_alloc (n);


    gsl_vector * work = gsl_vector_alloc (n);
    gsl_linalg_SV_decomp (gA_t, V, S, work);
    gsl_vector_free(work);

    gsl_matrix_memcpy (U, gA_t);


//Take exponential of S and form matrix
    gsl_matrix_complex * Sp = gsl_matrix_complex_alloc (n, n);
    gsl_matrix_complex_set_zero (Sp);
    for (i = 0; i < n; i++) {
        gsl_matrix_complex_set (Sp, i, i, gsl_complex_exp ( gsl_complex_mul_real ( img, gsl_vector_get(S, i) ) ) ); // Vector 'S' to matrix 'Sp'
    }

    gsl_matrix_complex * Uc = gsl_matrix_complex_alloc (n, n);


//convert U to a complex matrix for next step   
    for (i = 0; i < n; i++) {
        for ( j = 0; j<n; j++) {
            gsl_matrix_complex_set (Uc, i, j, gsl_complex_rect ( gsl_matrix_get(U, i, j), 0. ) );       
        }
    }


//recombine U S Utranspose  
    gsl_matrix_complex * tA = gsl_matrix_complex_alloc (n, n);
    gsl_matrix_complex * eA = gsl_matrix_complex_alloc (n, n);
    gsl_blas_zgemm (CblasNoTrans, CblasNoTrans, GSL_COMPLEX_ONE, Uc, Sp, GSL_COMPLEX_ZERO, tA);
    gsl_blas_zgemm (CblasNoTrans, CblasTrans, GSL_COMPLEX_ONE, tA, Uc, GSL_COMPLEX_ZERO, eA);


//Print result  
    std::cout << "eA:" << std::endl;
    for (i = 0; i < n; i++)  
        for (j = 0; j < n; j++)
            printf ("%g + %g i\n", GSL_REAL(gsl_matrix_complex_get (eA, i, j)), GSL_IMAG(gsl_matrix_complex_get (eA, i, j)));
    std::cout << "\n" << std::endl;


//Free up
    gsl_matrix_free(gA_t);
    gsl_matrix_free(U);
    gsl_matrix_free(gA);
    gsl_matrix_free(V);
    gsl_vector_free(S);
    gsl_matrix_complex_free(Uc);
    gsl_matrix_complex_free(tA);    
    gsl_matrix_complex_free(eA);    

    return 0;
}
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私が質問に投稿した上記のコードは非常にうまく機能します。私が見つけたもう1つの改善点は、完全な行列乗算を実行するのではなく、Vのコピーの列を固有値でスケーリングすることでした。zgemmはこのコードの中で最も遅い部分であるため、zgemm関数の1つを削除すると、ほぼ2倍高速になります。すぐに完全なコードリストをここに投稿します。

于 2012-04-16T11:34:26.377 に答える