linux - 「-;」とは bashステートメントの最後にあるという意味ですか？

Question

例えば

bwa sampe ref.fa r1.sai r2.sai r1.fq r2.fq | samtools view -bSho out.bam -;

「-;」の目的は何ですか 最後に文字？彼らは何をしますか？なぜそれらが必要なのですか？

Answer 1

セミコロンはコマンドを終了します（パイプラインを終了することは、技術的には正しい言い方だと思います）。必要に応じて、次のように別のコマンドを実行できます。

bwa sampe ref.fa r1.sai r2.sai r1.fq r2.fq | samtools view -bSho out.bam -; echo Here is another command.

それ以外の場合、セミコロンは無害ですが、おそらく不要です。

-セミコロンの前にあるハイフン、for、およびその他の多くのコマンドに関してsamtoolsは、入力ファイルの代わりに標準入力を使用することを意味します（または、場合によっては、出力ファイルの代わりに標準出力を使用します）。これは典型的なLinux/Unixの使用法です。

（コマンドの使用法を確認してくれた@phatfingersに感謝しますsamtools。）