別のクラスからサブクラスを呼び出すとエラーが発生しますが、直接呼び出すとエラーが発生しません。このサブクラスのインスタンスを別のクラスから作成すると、スーパークラスの情報がサブクラスに渡されないようです。
class HBatom(object):
def __init__(self, struct, sele, **kwargs):
self.struct = struct
self.sele = sele
class HDonor(HBatom):
def __init__(self,struct,sele,**kwargs):
super(HDonor,self).__init__(struct,sele,**kwargs)
self.find_H()
def find_H(self):
bonded = self.struct.select(''.join(["bonded to ", self.sele.getSelstr()]))
これは機能します
import HBonds
HB = HBonds.HDonor(structure,Nsel,f_wat=1)
しかし、HDonors の辞書を含むクラスのインスタンスを作成してから、入力するように指示すると、エラーが発生します。
HN = HBonds.HNtwrk(structure,1)
HN.build_HNtwrk()
AttributeError: 'HDonor' object has no attribute 'sele'
pdb で実行すると、2 番目のケースでselfに HBatom 親クラスの属性が含まれていないことがわかります。selfが最初のケースではその情報を含むことができるのに、2 番目のケースではできないのはどうしてですか?
申し訳ありませんが、元の投稿に HNtwrk を含めませんでした。コードは全部で 400 行近くあるので、必要以上は入れたくありません。HNtwrkの関連部分は次のとおりです
class HNtwrk:
def __init__(self,structure, f_wat = 0):
self.f_wat = f_wat
self.struct = structure
self.rh_o = 2.5
self.rn_o = 3.5
self.Dons = dict()
self.Accs = dict()
def build_HNtwrk(self):
Dsele = self.struct.select(DonStr)
Asele = self.struct.select(AccStr)
self.addDons(Dsele)
self.addAccs(Asele)
def addDons(self, Dsele):
for pairs in iterNeighbors(Dsele,self.rn_o,Asele):
iN = pairs[0].getIndices()[0]
iA = pairs[1].getIndices()[0]
if iN not in self.Dons:
Hdon = HDonor(self.struct,pairs[0].getSelstr,f_wat=self.f_wat)
self.Dons[iN] = Hdon
HDonor.find_H() には HBatom 属性が必要なため、Hdon を設定するとコードがトリップします。HDonor インスタンスが HNtwrk から作成されるとき、HDonor 初期化中に HBatom.__init__() が呼び出されないのと同じです。明確にするために、HNtwrk は他のクラスと同じファイルに表示されます。