ここにはいくつかの小さな不具合があります。
- あなたは再現可能な例を私たちに与えていません:例えばhttp://tinyurl.com/reproducible-000を参照してください...
- あなたは
read.csv
おそらくread.table
- 何をしているのかわかりません
quartz=(title...)
。たぶんquartz(title=...)
?いずれにせよ、を使用plot()
すると、新しいグラフィックス ウィンドウが自動的に開きます。
- を使用する
attach
ことはしばしば悪い考えです
- 新しい(たとえば)予測データセットをプロットに追加するの
lines
ではなく、使用してください。curve
線形回帰の特定のケース (次のポイントを参照) では、 を使用できますabline
。
- 最も重要なこと: ここで行っていることは、ロジスティック回帰ではありません
glm
。通常の線形モデル (最小二乗回帰) に適合させるために使用していlm()
ます。ロジスティック回帰では、family=binomial
ではなくを使用しますfamily=gaussian
。さらに、ロジスティック回帰はバイナリ応答変数を対象としているため、中央オークランドの人口をモデル化するのに適している可能性は低いです...ロジスティック回帰とロジスティック成長曲線を混同していると思われます...
修正されたコードを次に示します。
dat <- read.csv("/Path/PopulationGrowth.csv")
with(dat,plot(Year,CentralOakland,xlab="Year",ylab="Population",
main="Central Oakland Population vs. Year"))
g <- lm(CentralOakland~Year,data=dat)
abline(g)
## OR
yearvec <- seq(min(Year),max(Year),length=51)
lines(yearvec,predict(g,newdata=data.frame(Year=yearvec),type="response"))
一方で、これはあなたが本当にやりたかったことかもしれません (データを提供してくれなかったので、ウィキペディアに行っていくつか入手しました ...)
## from http://en.wikipedia.org/wiki/Oakland,_California
dat <- structure(list(year = c(1860L, 1870L, 1880L, 1890L, 1900L, 1910L,
1920L, 1930L, 1940L, 1950L, 1960L, 1970L, 1980L, 1990L, 2000L,
2010L), pop = c(1543L, 10500L, 34555L, 48682L, 66960L, 150174L,
216261L, 284063L, 302163L, 384575L, 367548L, 361561L, 339337L,
372242L, 399484L, 390724L)), .Names = c("year", "pop"),
class = "data.frame", row.names = c(NA,-16L))
フィッティング:
## SSlogis() is a "self-starting" logistic
m1 <- nls(pop~SSlogis(year,asym,xmid,scal),
data=dat)
プロット:
par(las=1,bty="l",mar=c(5,6,2,2)+0.1) ## graphics tweaks
with(dat,plot(pop~year,ylab=""))
## add y-label separately
mtext("population",side=2,las=0,line=4)
yearvec <- 1860:2010
lines(yearvec,predict(m1,newdata=data.frame(year=yearvec)))