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（これは、私が良い答えを得たggplot2 loess Qに続きます）-このプロットにつながります：

最初の質問に画像を答える

私のRの知識はかなり限られています（ごめんなさい！）

テーブルdata1のデータを使用して散布図をプロットします。

data1<-NaRV.omit(data[,c(2,3,7,10)]) #(2=start, 3=end, 7=value, 10=type)
ylabs='E / A - ratio'
p1<-ggplot(data1, aes(x=start, y=value)) +
ylim(0,5) +
geom_point(shape=points, col=pointcol1, na.rm=T) +
geom_hline(aes(yintercept=1, col=linecol)) +
geom_smooth(method="loess", span=spanv, fullrange=F, se=T, na.rm=T) +
#
xlab(xlabs) +
ylab(ylabs)

一部の領域にはデータがありません（中央に1つの大きな領域がありますが、小さな個別の領域も含まれます）。この事実を説明するために、y=0で色付きのセグメントを描画します。

両方のデータ型をラベルcolumn＃10 ='type'（散布データ='cnv'およびno-data='nregion'のコンテンツ）を持つ1つのテーブルに結合しました。nregionsの値の列は0です。

分散用に「cnv」データのみを取得し、セグメントを描画するために「nregion」データのみを取得するにはどうすればよいですか。同じプロットの両方？

geom_segmentを見つけました：

+ geom_segment(aes(x=data1$start, y=0, xend=data1$end, yend=0))

しかし、各ggplotサブプロットをサブセット化する方法が見つかりませんでした。

ありがとう

####@gaudenソリューションのフォローアップ

こんにちは@gauden私はあなたのアプローチを試しました、そしてそれは部分的にうまくいきました。私の問題は、]-1を使用する場合ほどデータをうまく分割できないことです。0]私のnregionは散在しており（画像の青い点と線で表されています）、次の画像のように、新しいグラフごとに異なります。

複数のセグメントを持つターゲット画像

その結果、レスは以前のように大きなnregionを通過します。nregionsでレスを防ぐにはどうすればよいですか？

#############################
## plot settings (edit below)
spanv<-0.1
pointcol1="#E69F00"
pointcol2="#56B4E9"
pointcol3="#009E73"
points=20
onecol="green"
colnreg="blue"
xlabs=paste(onechr, " position", " (loess-span=", spanv, ")", sep="")

##### end edit ##############

########################################################
## using the center coordinate of each segment and points

## prepare plot #1
# plot E / A - ratio
## draw loess average for cnv
## draw line for nregion
ylabs='E / A - ratio'
p1<-ggplot(chrdata, aes(x=start+1000, y=E.R, group=type, label=type)) +
ylim(0,5) +
geom_hline(aes(yintercept=1, col=onecol)) +
geom_point(data = chrdata[chrdata$type != 'nregion',], shape=points, col=pointcol2) +
geom_smooth(data = chrdata[chrdata$type != 'nregion',], method="loess", span=spanv) +
geom_point(data = chrdata[chrdata$type == 'nregion',], col=colnreg) +
geom_segment(data = chrdata[chrdata$type == 'nregion',], aes(x=start, y=E.R, xend=end, yend=E.R), colour=colnreg, linetype=1, size=1) +
xlab(xlabs) +
ylab(ylabs)
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編集：明確な要求を可能にするための完全な改訂

これが私のターゲットプロットです： 複数セグメントの散布図

そして、これを生成するコードは次のとおりです。

library("ggplot2")

# CREATE DATA FRAME
# This is the sort of data that I understand you to have
start <- rnorm(200)
value <- rnorm(200) 
df <- data.frame( cbind(start, value) )
df[ df$start > -0.6 & df$start <= 0, "value"] <- 0
df[ df$start > -1.6 & df$start <= -1.3, "value"] <- 0
df[ df$start > 0.9 & df$start <= 1.2, "value"] <- 0

df$type <- rep('cnv', 200)
df[ df$value == 0, "type"] <- 'nregion'
df[ df$value != 0, "type"] <- 'cnv'

# SORT the data frame by value so that the 'cnv' and 
# 'nregion' chunks become contiguous
df <- df[order(start),]

# See note below. 
r <- rle(df$type)
df$label <- rep(seq(from=0, length=length(r$lengths)), times=r$lengths)

# set up plot with colour aesthetic to distinguish the three regions
# playing around with colour and group produces different effects
p <- ggplot(df, aes(x = start, 
                    y= value,
                    colour=type,
                    group = label)
            )
p <- p + theme_bw()
# draw points outside the 'nregion'
p <- p + geom_point( data = df[df$type != 'nregion',] )

# draw smoothed lines outside the 'nregion'
p <- p + geom_smooth( data = df[df$type != 'nregion',] )


# plot zero points inside the 'nregion' 
p <- p + geom_smooth( data = df[df$type == 'nregion',], size = 2 )
p

の使用については、補足質問rleへの回答でさらに説明されています

于 2012-05-11T22:28:53.750 に答える