git bookで説明されているようにサブモジュールを変更してみてください
$ git rm -r vendor/html-minifier
$ git submodule add https://github.com/kangax/html-minifier.git vendor/html-minifier
しかし、それは次のように失敗します
rm 'vendor/html-minifier'
fatal: git rm: 'vendor/html-minifier': Is a directory