ダウンロードしたファイルを分離ストレージに保存しています。ダウンロードしているxmlファイルはそのようにエンコードされているため、エンコードをiso-8859-1に設定したいと思います。
var stream = new IsolatedStorageFileStream("myfile.xml", FileMode.Create, FileAccess.Write, myIsolatedStorage);
using (StreamWriter writeFile = new StreamWriter(stream)) {
string xml_file = e.Result.ToString();
writeFile.WriteLine(xml_file);
writeFile.Close();
}