学期が終了し、いくつかのパッケージを R 2.15 まで上げています (学生が使用している間は変更したくなかったため)。だから私はR 2.14の下で働いていたいつものことをしています。私が見る限り、ドキュメントはこれに関して変更されていませんが、見落としている可能性があります。
私は自分のパッケージを編集しましたChemoSpec
が、チェックしようとすると、R は についてエラーを出し、packages required but not available
それらを一覧表示します。これらのパッケージは利用可能で、a- を指しているローカル ディレクトリにあります。
.libPaths()
[1] "/Users/bryanhanson/R_pkgs"
[2] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library"
不足しているとされるパッケージは、実際には/Users/bryanhanson/R_pkgs
.
私は.Rprofile
チェックプロセスによってスキップされていることを認識しているため、 代わりに.libPaths
設定されていません。次の行を含むファイルがあります。.Rprofile
check.Renviron
/Users/bryanhanson/.R
# Bryan's check.Renviron for customizing check environment
# resides in /Users/bryanhanson/.R
R_LIBS = /Users/bryanhanson/R_pkgs
ターミナルで次のコマンドで確認しようとしました
R --as-cran CMD check ChemoSpec
R --vanilla CMD check ChemoSpec
これらのそれぞれに対する応答はわずかに異なりますが、依存関係が見つからないためにどちらも失敗します。R は、/Users/bryanhanson/R_pkgs
私がそうするように指示したと思いますが、どうやら R が検索していないためです。
助言がありますか?それは単純なものでなければなりません。
これが sessionInfo() です。
sessionInfo()
R version 2.15.0 (2012-03-30)
Platform: x86_64-apple-darwin9.8.0/x86_64 (64-bit)
locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] sos_1.3-1 brew_1.0-6