これは、struts.custom.i18n.resourcesプロパティにリソースを書き込む順序と関係があります。
最後のものが「勝ちます」。
今、あなたは持っています
struts.custom.i18n.resources=file1,file2
file2が最後であるため、file2が優先され、出力は「ユーザー名1」になります。
あなたが持っていた場合
struts.custom.i18n.resources=file2,file1
file1が最後になるため、出力は「ユーザー名」になります。