Apple のプロビジョニング システムが提供するツールについてのみ質問している場合は、そうです。開発した各アプリを実行できるデバイスを正確に指定できます。また、アプリごとに、アプリの実行が許可されているデバイスのセット (最大 100 個) が異なる可能性があります。
アプリごとに個別のプロビジョニング プロファイルを作成するだけです。また、iOS 開発者ポータルでこれらのアプリのプロビジョニング プロファイルを作成する場合は、開発プロビジョニング プロファイル、またはアドホック配布方法を使用する配布プロビジョニング プロファイルを作成する必要があります。
アドホック プロビジョニング プロファイル (または開発プロファイル) を作成したら、その設定を使用して、そのアプリの実行を許可するデバイスを (簡単なチェック ボックスで) 選択できます。また、個別のプロビジョニング プロファイルごとに、他とは異なる独自のチェック ボックスのセットがあります。
次に、Xcode でプロジェクトの設定を変更して、アプリが異なるプロファイルでビルドされるようにします。
補足: 私の知る限り、既存のプロビジョニング プロファイルを「社内」から「アドホック」に変換する方法はありません。そのため、現在のプロビジョニング プロファイルが「社内」である場合は、新しいプロビジョニング プロファイルを作成する必要がある場合があります。奇妙なことに、「Ad Hoc」から「In House」に変換できます。
補足 #2: Apple Developer アカウントに関連付けることができるデバイスは合計 100 個まで (それぞれの UDID で指定) に制限されます。しかし、あなたが説明しているような基本的なテストでは、これは問題にならないと思います。