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R パッケージ 'pkgDepTools' と 'Rgraphviz' を必要とするコードを実行しようとしました。R バージョン 2.15.0 ではどちらのパッケージも利用できないというエラー メッセージを受け取りました。

Google で検索すると、パッケージがあると思われる次の Web ページ RPM Pbone が見つかりました。

http://rpm.pbone.net/index.php3/stat/4/idpl/17802118/dir/mandrake_other/com/R-pkgDepTools-1.20.0-1-mdv2012.0.i586.rpm.html

と

http://rpm.pbone.net/index.php3/stat/4/idpl/17802080/dir/mandrake_other/com/R-Rgraphviz-1.32.0-2-mdv2012.0.i586.rpm.html

ただし、ファイルには、私が慣れている *.tar.gz または *.zip 拡張子ではなく、*.rpm 拡張子が付いています。

Windows 7 と R バージョン 2.15.0 を使用しています。*.rpm ファイルから R パッケージをインストールできますか?

ウィキペディアから *.rpm はおそらく Linux 向けのようです:

http://en.wikipedia.org/wiki/RPM_Package_Manager

他の考えられる解決策については、最新バージョンの R で利用できない R パッケージのインストールに関する同様の質問を含むいくつかの以前の投稿をここで見つけました。

Rの二変量ポアソン回帰?

パッケージ「GeneR」は利用できません

R ベン図パッケージ 由緒ある入手不可 - 代替パッケージ?

Rtools の最新バージョンとパッケージ 'devtools' をインストールしました。私は彼らについて何も知りませんが。

ここに「Rgraphviz」のアーカイブ バージョンがあります。

http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/Rgraphviz/

しかし、「pkgDepTools」のアーカイブ バージョンが見つかりません。

上記の *.rpm ファイルを使用して Windows マシンにパッケージをインストールできる場合、どなたか手順を教えていただけないでしょうか?

Rtools を使用してビルドする必要がある場合は、以下のリンクの手順が難しいため、さらに質問する可能性があります。

http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-admin.html#Building-from-source

完全に透明にするために、可能であれば、誰かが私のためにそれらを構築してくれることを望んでいます。自分でそれを行うことで得た経験と知識は、長期的にはおそらく報われると認識していますが.

アドバイスありがとうございます。

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pkgDepToolsとRgraphvizは、CRAN でホストされているものではなく、BioConductor R パッケージです。これらのリポジトリからパッケージをダウンロードするように R を構成しない限り、R はそれらが利用できないと報告します。インストール元として構成されているリポジトリからのみインストールできます。

これらの BioConductor パッケージをインストールするために、簡単なインストール方法が提供されています。

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite(c("pkgDepTools", "Rgraphviz"))

詳細については、BioConductor Web サイトのインストールページを参照してください。

通常、Windows では rpm パッケージを使用できません。rpm は、Linux のバイナリ パッケージに相当します。C/C++/Fortran/etc のコードはすべて、Windows ではなく Linux 用にコンパイルされています。お使いのバージョンの R でパッケージが実際に利用できない場合は、CRAN に記載されている理由があるかどうかを確認してください (通常、Windows バイナリの生成には数日かかるか、CRAN Windows ビルド マシンで利用できないソフトウェアの要件がある可能性があります)。 . Uwe Ligges が実行する WinBuilder サービスを試して、パッケージの Windows バイナリをビルドできますが、パッケージが CRAN 上にあり、現在そうでない場合は、現在の R では動作しなくなり、ビルドできません。

一般に、パッケージの検索範囲を広げてみてください。検索文字列「pkgDepTools」の下にある私の Google 検索結果の最初のヒットは、Windows バイナリへのリンクと R 内からパッケージをインストールする方法に関する指示を含む、パッケージの Bioconductor ページです。

于 2012-05-27T08:15:25.853 に答える