以下のコードを使用して、k 平均のエルボーをプロットしようとしています。
load CSDmat %mydata
for k = 2:20
opts = statset('MaxIter', 500, 'Display', 'off');
[IDX1,C1,sumd1,D1] = kmeans(CSDmat,k,'Replicates',5,'options',opts,'distance','correlation');% kmeans matlab
[yy,ii] = min(D1'); %% assign points to nearest center
distort = 0;
distort_across = 0;
clear clusts;
for nn=1:k
I = find(ii==nn); %% indices of points in cluster nn
J = find(ii~=nn); %% indices of points not in cluster nn
clusts{nn} = I; %% save into clusts cell array
if (length(I)>0)
mu(nn,:) = mean(CSDmat(I,:)); %% update mean
%% Compute within class distortion
muB = repmat(mu(nn,:),length(I),1);
distort = distort+sum(sum((CSDmat(I,:)-muB).^2));
%% Compute across class distortion
muB = repmat(mu(nn,:),length(J),1);
distort_across = distort_across + sum(sum((CSDmat(J,:)-muB).^2));
end
end
%% Set distortion as the ratio between the within
%% class scatter and the across class scatter
distort = distort/(distort_across+eps);
bestD(k)=distort;
bestC=clusts;
end
figure; plot(bestD);
bestD
(クラスター分散内/クラスター分散間)の値は
[
0.401970132754914
0.193697163350293
0.119427184084282
0.0872681777446508
0.0687948264457301
0.0566215549396577
0.0481117619129058
0.0420491551659459
0.0361696583755145
0.0320384092689509
0.0288948343304147
0.0262373245283877
0.0239462330460614
0.0218350896369853
0.0201506779033703
0.0186757121130685
0.0176258625858971
0.0163239661159014
0.0154933431470081
]
このコードは、2005 年 3 月、カリフォルニア工科大学の Lihi Zelnik-Manor から改作されました。
クラスター間分散に対するクラスター内分散のプロット比は、曲線のように滑らかな膝を持つ滑らかな曲線bestD
です。上記のプロット データ。このようなグラフの膝をどのように見つけますか?