IntelliJ IDEA 11.1.2 Ultimate withGradle1.0マルチモジュールプロジェクトを使用しています。1つのモジュールがドメインを表します。
プロジェクトの出力は[project-root]\outを指します。しかし、単体テストを実行すると、ドメインモジュールの出力フォルダーに.sqlファイルがまったく含まれていません。。これが、IntelliJIDEA内でJUnitテストを実行する方法です。
コマンドラインからGradleを使用してプロジェクトを実行すると、すべてが正常に機能します。