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適切なx（ベクトル行列またはデータフレーム）入力がどのように見えるかを知りたいです。私は現在、2つの異なる種類の行列で関数を使用しています。ただし、Rが私のデータを意図した方法でどのように解釈するかはわかりません。マトリックスの種類を例で説明します。

タイプ1

           Gene1 Gene2 Gene3
    sample1
    sample2

タイプ2

          Sample1 Sample2 Sample3
gene 1
gene 2
gene 3

これらの形式のいずれかが有効なxパラメーターですか？両方のタイプの行列を入力していくつかの結果を取得しましたが、これが関数を適切に使用しているかどうかがわからない場合、これらは単なる乱数です。お時間をいただきありがとうございます。これはもっと面白くないことをお詫びします。

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Xが行列の場合cor(X)、行数と列数が元の行列の列数と等しい正方相関行列が生成されます。つまり、corマトリックス内の列間の相関を生成します。簡単な例を次に示します。

> x <- rnorm(5)
> y <- rnorm(5)
> cbind(x,y)
            x        y
[1,]  1.67287  1.70663
[2,] -1.23120  0.56948
[3,]  0.67538 -0.20596
[4,] -1.21077  0.11648
[5,]  0.60409  1.15405

> cor(cbind(x,y))
        x       y
x 1.00000 0.56329
y 0.56329 1.00000

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于 2012-06-24T03:40:49.823 に答える