私の基本的な質問は、抑制ファイルが valgrind でどのように機能するかについてです。私は、mpi バージョン > 1.5 (私のバージョンは 1.6) で以下を使用することを示す多くのドキュメントを見てきました。
mpirun -np 2 valgrind --suppressions=/usr/share/openmpi/openmpi-valgrind.supp --track-origins=yes ./myprog
ただし、このように実行すると、ファイルには600を超えるエラーがあります! 私が得ているエラーは、これら2つを何度も繰り返しています。現在の valgrind と mpi の理解では、これらのいずれかを解釈する方法がわかりません。
==8821== Address 0xad5e4d7 is 87 bytes inside a block of size 128 alloc'd
==8821== at 0x4C2B6CD: malloc (in /usr/lib/valgrind/vgpreload_memcheck-amd64-linux.so)
==8821== by 0x6348C52: ??? (in /usr/lib/openmpi/lib/libopen-pal.so.0.0.0)
==8821== by 0x6349AF1: ??? (in /usr/lib/openmpi/lib/libopen-pal.so.0.0.0)
==8821== by 0x6349B81: ??? (in /usr/lib/openmpi/lib/libopen-pal.so.0.0.0)
==8821== by 0x7DA5B9C: ??? (in /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so)
==8821== by 0x7DA52F4: ??? (in /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_grpcomm_bad.so)
==8821== by 0x5082AF2: ??? (in /usr/lib/openmpi/lib/libmpi.so.0.0.2)
==8821== by 0x50A33FA: PMPI_Init (in /usr/lib/openmpi/lib/libmpi.so.0.0.2)
==8821== by 0x408AB5: main (test_send-receive.cpp:8)
==8821== Uninitialised value was created by a heap allocation
==8821== at 0x4C2B6CD: malloc (in /usr/lib/valgrind/vgpreload_memcheck-amd64-linux.so)
==8821== by 0x635FE2B: ??? (in /usr/lib/openmpi/lib/libopen-pal.so.0.0.0)
==8821== by 0x6360634: opal_ifcount (in /usr/lib/openmpi/lib/libopen-pal.so.0.0.0)
==8821== by 0x81B36AA: ??? (in /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_oob_tcp.so)
==8821== by 0x5C01EE2: mca_oob_base_init (in /usr/lib/openmpi/lib/libopen-rte.so.0.0.0)
==8821== by 0x7FA97FB: ??? (in /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_rml_oob.so)
==8821== by 0x5C083E4: orte_rml_base_select (in /usr/lib/openmpi/lib/libopen-rte.so.0.0.0)
==8821== by 0x5BF5EC4: orte_ess_base_app_setup (in /usr/lib/openmpi/lib/libopen-rte.so.0.0.0)
==8821== by 0x7BA1EAE: ??? (in /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_ess_env.so)
==8821== by 0x5BDDB72: orte_init (in /usr/lib/openmpi/lib/libopen-rte.so.0.0.0)
==8821== by 0x50822E0: ??? (in /usr/lib/openmpi/lib/libmpi.so.0.0.2)
==8821== by 0x50A33FA: PMPI_Init (in /usr/lib/openmpi/lib/libmpi.so.0.0.2)
これらのエラーを生成するコードは次のとおりです。
int main(int argc, char *argv[]) {
/* init MPI */
MPI_Init(&argc, &argv);
int myid;
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &myid);
int i;
if(myid == 0){
double * d = new double [10];
for(i = 0; i<10; i++){
d[i] = i + 1.0;
}
MPI_Send(d,
10,
MPI_DOUBLE,
1,
1,
MPI_COMM_WORLD);
delete[] d;
} else {
MPI_Status status;
double * c = new double [10];
MPI_Recv(c,
10,
MPI_DOUBLE,
0,
MPI_ANY_TAG,
MPI_COMM_WORLD,
&status);
for(i = 0; i<10; i++){
printf("%f\n", c[i]);
}
delete[] c;
}
MPI_Finalize();
return 0;
}
また、このコードは正常に実行され、期待される結果が出力されます。データがネットワーク経由で送信される方法を誤解していますか、それとも理解できない何かがここで起こっていますか?
投稿が長くなって申し訳ありませんが、ここまで読んでくれてありがとうございます。