これをうまく行う拡張機能/モジュール/などを見つけることができないようです。
次のように列のメタデータにアクセスできますが、モデルのインデックスにフローチャートまたはハイパーグラフとして表示する良い方法が必要です。
$m=new MyModel;
Yii::log(CVarDumper::dumpAsString($m->tableSchema->columns),'warning');
// echo $m->toJSON(); // json 動作を使用し、これを js フローチャートに渡してスキーマを表示します