27

負の配列ゼロのすべての値を設定します。

私は多くのことを試しましたが、まだ実用的な解決策を達成していません。条件付きのforループを考えましたが、うまくいかないようです。

#pred_precipitation is our array
pred_precipitation <-rnorm(25,2,4)     

for (i in nrow(pred_precipitation))
{
  if (pred_precipitation[i]<0) {pred_precipitation[i] = 0}
  else{pred_precipitation[i] = pred_precipitation[i]}
}
4

4 に答える 4

66

再現可能な例をありがとう。これはかなり基本的な R のものです。ベクトルの選択した要素に割り当てることができます (配列には次元があり、指定したのは配列ではなくベクトルであることに注意してください)。

> pred_precipitation[pred_precipitation<0] <- 0
> pred_precipitation
 [1] 1.2091281 0.0000000 7.7665555 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5151504 0.0000000 1.8281251
[10] 0.5098688 2.8370263 0.4895606 1.5152191 4.1740177 7.1527742 2.8992215 4.5322934 6.7180530
[19] 0.0000000 1.1914052 3.6152333 0.0000000 0.3778717 0.0000000 1.4940469

ベンチマーク戦!

@James はさらに高速な方法を見つけ、コメントに残しました。彼の勝利が短命であることを知っているという理由だけで、私は彼に賛成票を投じました。

まず、コンパイルを試みますが、それは誰にも役立たないようです:

p <- rnorm(10000)
gsk3 <- function(x) { x[x<0] <- 0; x }
jmsigner <- function(x) ifelse(x<0, 0, x)
joshua <- function(x) pmin(x,0)
james <- function(x) (abs(x)+x)/2
library(compiler)
gsk3.c <- cmpfun(gsk3)
jmsigner.c <- cmpfun(jmsigner)
joshua.c <- cmpfun(joshua)
james.c <- cmpfun(james)

microbenchmark(joshua(p),joshua.c(p),gsk3(p),gsk3.c(p),jmsigner(p),james(p),jmsigner.c(p),james.c(p))
           expr      min        lq    median        uq      max
1     gsk3.c(p)  251.782  255.0515  266.8685  269.5205  457.998
2       gsk3(p)  256.262  261.6105  270.7340  281.3560 2940.486
3    james.c(p)   38.418   41.3770   43.3020   45.6160  132.342
4      james(p)   38.934   42.1965   43.5700   47.2085 4524.303
5 jmsigner.c(p) 2047.739 2145.9915 2198.6170 2291.8475 4879.418
6   jmsigner(p) 2047.502 2169.9555 2258.6225 2405.0730 5064.334
7   joshua.c(p)  237.008  244.3570  251.7375  265.2545  376.684
8     joshua(p)  237.545  244.8635  255.1690  271.9910  430.566

コンパイルされた比較

ちょっと待って!Dirk がこの Rcpp のことを書きました。完全に C++ の無能な人が、JSS の論文を読み、その例を適応させて、それらすべての中で最速の関数を書くことができるでしょうか? 親愛なるリスナーの皆さん、お楽しみに。

library(inline)
cpp_if_src <- '
  Rcpp::NumericVector xa(a);
  int n_xa = xa.size();
  for(int i=0; i < n_xa; i++) {
    if(xa[i]<0) xa[i] = 0;
  }
  return xa;
'
cpp_if <- cxxfunction(signature(a="numeric"), cpp_if_src, plugin="Rcpp")
microbenchmark(joshua(p),joshua.c(p),gsk3(p),gsk3.c(p),jmsigner(p),james(p),jmsigner.c(p),james.c(p), cpp_if(p))
         expr      min        lq    median        uq       max
1   cpp_if(p)    8.233   10.4865   11.6000   12.4090    69.512
2     gsk3(p)  170.572  172.7975  175.0515  182.4035  2515.870
3    james(p)   37.074   39.6955   40.5720   42.1965  2396.758
4 jmsigner(p) 1110.313 1118.9445 1133.4725 1164.2305 65942.680
5   joshua(p)  237.135  240.1655  243.3990  250.3660  2597.429

rcpp比較付き

その通りです、船長。

pこれにより、割り当てなくても入力が変更されます。その動作を回避したい場合は、複製する必要があります。

cpp_ifclone_src <- '
  Rcpp::NumericVector xa(Rcpp::clone(a));
  int n_xa = xa.size();
  for(int i=0; i < n_xa; i++) {
    if(xa[i]<0) xa[i] = 0;
  }
  return xa;
'
cpp_ifclone <- cxxfunction(signature(a="numeric"), cpp_ifclone_src, plugin="Rcpp")

残念ながら、これは速度の利点を殺します。

于 2012-06-30T15:15:58.360 に答える
19

時々少し遅くなる可能性があり、サブセット置換により追加のベクトルが作成されるため、使用します(これは大きなデータセットで問題になる可能性がありますpmax)。ifelse

set.seed(21)
pred_precipitation <- rnorm(25,2,4)
p <- pmax(pred_precipitation,0)

ただし、サブセット置換は断然最速です。

library(rbenchmark)
gsk3 <- function(x) { x[x<0] <- 0; x }
jmsigner <- function(x) ifelse(x<0, 0, x)
joshua <- function(x) pmin(x,0)
benchmark(joshua(p), gsk3(p), jmsigner(p), replications=10000, order="relative")
         test replications elapsed relative user.self sys.self
2     gsk3(p)        10000   0.215 1.000000     0.216    0.000
1   joshua(p)        10000   0.444 2.065116     0.416    0.016
3 jmsigner(p)        10000   0.656 3.051163     0.652    0.000

autoplot マイクロベンチマーク

于 2012-06-30T15:25:33.200 に答える
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または、次を使用することもできますifelse

ifelse(pred_precipitation < 0, 0, pred_precipitation)
于 2012-06-30T15:21:59.787 に答える