AWS マネジメント コンソールで、EC2 インスタンスを選択し、[インスタンス アクション] メニューから [接続] をクリックします。次のポップアップ ウィンドウが表示されます。
通常表示されるはずのフィールドの代わりに、ブラウザで Java を有効にすることに関する上記のメッセージが表示されます。しかし、私のブラウザではJavaが有効になっています。このページでテストし て確認しました。Java SE 6 Update 24 を実行しています。
Linux Mint 13 64bit で Google Chrome v20.0 を使用しています。Firefox でも試してみましたが、結果は同じです。Windows ボックスから問題なく Java SSH クライアントにアクセスできるため、Linux 固有の問題である可能性があります。