python - Mac OS Lion にプリインストールされている python 2.6.7 用の numpy と scipy

Question

Mac OS Lion に付属している python 2.6.7 に numpy と scipy をインストールする方法はありますか? Lion にも Python 2.7 があることは承知しています。しかし、Python 2.7 では動作しないモジュールを使用しているため、Python 2.6 に固執する必要があります。

Answer 1

Lion には、Python 実装ごとに easy_install が付属しています。/usr/bin/easy_install-2.7/usr/bin/python2.7

ただし、scipy には Fortran コンパイラが必要ですが、Lion にはそのようなコンパイラが付属していません。また、numpy をインストールする前に Fortran コンパイラをインストールする必要があるようです。そうしないと、後で scipy をインストールできません。

まず、Xcode コマンド ライン ツールが必要です。(Apple はこのパッケージの名前を頻繁に変更します。Xcode のバージョンに応じて、"Unix Development Tools" や "CLI Development Toolchain" などになります。)

これらは Xcode 自体でインストールできます。4.3.x を使用している場合は、App Store から Xcode をインストールした後、Xcode を起動し、[設定]、[ダウンロード]、[コンポーネント] の順に移動し、[コマンド ライン ツール] の横にある [インストール] ボタンをクリックします。異なるバージョンについて、または Xcode なしでそれらをインストールする場合は、Homebrew ページ (以下を参照) で入手方法を説明するか、Apple の開発者サイトを調べてください。

パッケージ マネージャー (Homebrew、MacPorts、または Fink) を既に持っている場合は、それを使用します。そうでない場合は、Homebrewをインストールします。

curl https://raw.github.com/gist/323731/25f99360c7de3f72027d8fd07cb369b1c8756ea6/install_homebrew.rb -o /tmp/install_homebrew.rb
ruby /tmp/install_homebrew.rb
rehash

次に、次のように gfortran をインストールします。

brew install gfortran

これで、numpy と scipy をインストールする準備が整いました。easy_install よりもpipを好む場合(わからない場合は、おそらく pip を好むでしょう)、最初にそれをインストールする必要があります。

sudo easy_install-2.6 pip

次に、それを使用してパッケージをインストールします。

sudo pip-2.6 install numpy

OS の正確なバージョンやその他の詳細によっては、2.6 用の numpy が既に組み込まれている場合がありますが、その numpy は Fortran をサポートしていません。sudo pip-2.6 install numpyと言っているので、これを伝えることができますRequirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): numpy in /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python。解決策は、エラー メッセージの内容を正確に実行することです。

sudo pip-2.6 install --upgrade numpy

そして最後に：

sudo pip-2.6 install scipy

Answer 2

Mountain Lion に SciPy をインストールすると、同様の問題が発生しました。

OSXマウンテンライオン10.8

パイソン 2.7.3

ピップ1.1

醸造0.9.2

GNU Fortran (GCC) 4.2.1

私が受け取っていたエラーのいくつかは次のとおりです。

これ：

pip install scipy

このエラーが発生しました：

Could not locate executable pgfortran

don't know how to compile Fortran code on platform 'posix'

building 'dfftpack' library

error: library dfftpack has Fortran sources but no Fortran compiler found

そのため、Fortran コンパイラを探すようになりました。

このコマンド:

brew install gfortran

このエラーが発生しました：

Error: Currently the gfortran compiler provided by this brew is only supports the following versions of XCode:

    - XCode 3.1.4 on OS X 10.5.x
    - XCode 3.2.2/3.2.3 -- 4.0 on OS X 10.6.x
    - XCode 4.1 or newer on OS X 10.7.x

The AppStore and Software Update can help upgrade your copy of XCode.
The latest version of XCode is also available from:

http://developer.apple.com/technologies/xcode.html

これにより、ブログ投稿http://www.joewandy.com/にたどり着きました。私はこの推奨事項に従いました：

このコマンド:

brew edit gfortran

xcodeを使用してファイルを開きます。このファイルを正確に 2 つの場所で変更しました。

論文2行：

if MacOS.xcode_version >= '4.2' and MACOS_VERSION == 10.7
    ohai "Installing gfortran 4.2.4 for XCode 4.2 (build 5666)"

変更:

if MacOS.xcode_version >= '4.2' and MACOS_VERSION >= 10.7
    ohai "Installing gfortran 4.2.4 for XCode 4.2 (build 5666) or higher"

言い換えると：

に変更== 10.7され>= 10.7 、に変更XCode 4.2 (build 5666)されましたXCode 4.2 (build 5666) or higher

それから私はやった

brew install gfortran

また。次のメッセージで成功しました：

Downloading http://r.research.att.com/tools/gcc-42-5666.3-darwin11.pkg

Already downloaded: /Library/Caches/Homebrew/gfortran-4.2.4-5666.3.pkg
==> Installing gfortran 4.2.4 for XCode 4.2 (build 5666) or higher
==> Caveats
Brews that require a Fortran compiler should not use:

depends_on 'gfortran'

The preferred method of declaring Fortran support is to use:

def install
    ...
    ENV.fortran
    ...
end

==> Summary

/usr/local/Cellar/gfortran/4.2.4-5666.3: 86 files, 72M, built in 2 seconds

それから私はしました：

pip install scipy

しかし、それは私にこれを与えました:

#error "<vecLib/vecLib.h> is deprecated.  Please #include <Accelerate/Accelerate.h> and link to Accelerate.framework."

その後、次のブログ記事を見つけました。Mountain Lion で SciPy をコンパイル http://www.thisisthegreenroom.com/2012/compiling-scipy-on-mountain-lion/

このコマンドを使用すると言いました：

pip install -e git+https://github.com/scipy/scipy#egg=scipy-dev

5～6分ほどで完了しました

Installed /Users/hernamesbarbara/src/scipy
Successfully installed scipy
Cleaning up...

その後、私はできる

python


Python 2.7.3 (v2.7.3:70274d53c1dd, Apr  9 2012, 20:52:43) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import scipy
>>> help(scipy)

    Help on package scipy:

NAME
    scipy

成功！

インストールされている SciPy バージョン:

full_version = '0.12.0.dev-14b1e07'
git_revision = '14b1e07602ff33a6e8250eb2bc7a6816677606a9'
release = False
short_version = '0.12.0'
version = '0.12.0.dev-14b1e07'

Answer 3

Brew とXCodeをインストールする必要も、自分で gfortran をコンパイルする必要もないと思います。(私は 10.7.5 を使用しています)