r - R でのレポートの作成

Question

Rstudioに同様の質問を投稿しましたが、スタック ユーザーにも質問すると便利だと思いました。

私の質問は基本的に次のとおりです: 他の人が簡単にコメントできる R グラフィックスが埋め込まれたドキュメントをどのように作成しますか?

ここ数か月、R から大量のプロットやテーブルを貼り付けずに、社内で R 分析をすばやく循環させる方法を考えていました。R コードを埋め込むことには興味がありませんが、カスタマイズできるようにしたいと考えています。 R2wd パッケージには大きな可能性がありますが、Rstudio は HTML、pdf、および Latex での高品質ドキュメントの作成全体をはるかに直感的にしています。これらの形式は一般に、はるかに柔軟で、見栄えがよく、R の機能を最大限に活用できます。

Word に一般的に関連付けられている (しかし、必ずしも正しくない) 関数があり、これらの他の形式に切り替える可能性が低くなります (これも間違っている可能性があります)。分析が完了すると、共有ドライブにアップロードされるか、電子的に回覧され、同僚/監督者/は次のことができます。

1. 変更の追跡を使用してドキュメントを確認します (つまり、テキストを編集してから、変更を受け入れるかどうかを選択できます)。
2. テキストのセクションにコメントします (コメント)。

これらの 2 つの機能は、外出先でレポートを公開する場合 (特に、これまでにレビューされたことのない新しいタイプの分析) に非常に重要です。Rstudio で現在サポートされている形式 (HTML、latex など) でこれをどのように行うのか疑問に思っていました。 、pdf）、またはこれらの問題に一般的にどのように対処するか。PDF などのより優れた形式に切り替えたいと思っていますが、上記の 2 つの機能が失われることになるかどうかはわかりません。

Answer 1

あなたが議論したツール (rstudio および sweave/knitr) と組み合わせてpandoc、これらのツールによって作成された形式から、word .docx ファイル (およびその他) を含む他のツールに変換するプログラムを確認することをお勧めします。したがって、1 つのオプションは、R または Rstudio で基本的なテンプレート ファイルを作成し、組み込みツールを使用して作業し、作成中にそれを表示することです。次に、ドキュメントを共有する準備ができたら (埋め込みグラフ、出力などを含む)、.docx ファイルに変換できます。共同作業者はコメントを付けたり、変更を追跡したりできます。

他のオプションは、R2wd (質問で述べたように、ただし、無料ではないツールを使用することに注意してください) または R2HTML または rtf パッケージを使用して、ms word を使用して読み取ることができるこれらのタイプのファイルを作成することです。

Answer 2

Sweave（ベースR）とknitrを見てください---そして、まったく同じトピックに焦点を当てた再現可能な研究に関するCRANタスクビューのすべて。

Answer 3

編み上げた HTML を Google ドキュメントにインポートできるかもしれません。変更を追跡するだけでなく、リアルタイムで編集することもできます。しかし、私はこれを試しませんでした。

Answer 4

これがあなたの質問に対する私の考えです。再現可能なレポート (またはデータ分析) を作成することに関しては、Dirk が推奨しているように、knitr または Sweave を使用することをお勧めします (個人的には、knitr の方が好きです)。私が働いている会社では、すべてのレポートを再現可能な形式で書いているので、人々が私の研究を再現できるようにするだけでなく、いくつかのパラメーターを簡単に変更できるようにしています。ちょっと待って。

編集と校正の部分については、http://www.mendeley.com/を使用できます。私は Mendeley に私のチームとのプライベート グループを持っており、私のレポートを彼らと共有しており、彼らはレポートに簡単にコメントすることができます。ドキュメントを相互に共有することもできます。それは私にとって非常に便利です。