file.contain.query.txt
ENST001
ENST002
ENST003
file.to.search.in.txt
ENST001 90
ENST002 80
ENST004 50
ENST003には2番目のファイルにエントリがなく、ENST004には1番目のファイルにエントリがないため、期待される出力は次のとおりです。
ENST001 90
ENST002 80
特定のファイルでマルチクエリをgrepするには、通常、次のようにします。
grep -f file.contain.query <file.to.search.in >output.file
file.to.search.inに10000クエリとほぼ100000rawが含まれているので、完了するまでに非常に長い時間がかかります(5時間など)。grep -fの高速な代替手段はありますか?