この例に従って、プロットするポリゴンを作成します。この例ggplot
に従って、データがサブセット化されている場合は、別個の凸包を作成できます。ただし、ddply
グループ化変数があるために適用しようとすると、適用できません。グループ化変数が追加された例のコードは次のとおりです。
library(grDevices) # load grDevices package
df <- data.frame(X = c(-62, -40, 9, 13, 26, 27, 27),
Y = c( 7, -14, 10, 9, -8, -16, 12), id = c(1, 1, 1, 2, 2, 3, 3))
con.hull.pos <- ddply(df, .(id), summarize, hullpos = chull(X, Y)) # get convex hull positions by each ID
ここで、各IDの完全なポリゴンを取得するには、で指定されているように各IDですべての行を取得する必要がありますがcon.hull.pos
、各グループの最初の行も追加する必要があります。
df[ddply(con.hull.pos, .(id), function(x) x[1, ])$hullpos, ] # first row of position
df[con.hull.pos$hullpos ,] ## all rows of position
rbind(df[con.hull.pos$hullpos ,] , df[ddply(con.hull.pos, .(id), function(x) x[1, ])$hullpos, ])
ddplyを使用した最初の行は、IDの凸包の最初の行と同じではないため、ここで私のコードは失敗します。したがって、ポリゴンは完全ではありません。誰かが変数でグループ化することによって与えられた例を適用するのを手伝ってくれませんか。
手動でサブセット化する場合、このコードは3つのID領域をカバーする3つの別々のポリゴンを作成するため機能します
id1_df <- subset(df, id==1)
id1_con.hull.pos <- chull(id1_df$X, id1_df$Y)
id2_df <- subset(df, id==2)
id2_con.hull.pos <- chull(id2_df$X, id2_df$Y)
id3_df <- subset(df, id==3)
id3_con.hull.pos <- chull(id3_df$X, id3_df$Y)
id1_con.hull <- rbind(id1_df[id1_con.hull.pos,], id1_df [id1_con.hull.pos[1],])
id2_con.hull <- rbind(id2_df [id2_con.hull.pos ,], id2_df [id2_con.hull.pos [1],])
id3_con.hull <- rbind(id3_df [id3_con.hull.pos,], id3_df [id3_con.hull.pos[1],])
poly_borders <- rbind(id1_con.hull, id2_con.hull, id3_con.hull)
plot(Y ~ X, data = df) # plot data
lines(poly_borders) # add lines for convex hull