私は data.frame を持っています:
df1<-data.frame("Sp1"=1:6,"Sp2"=7:12,"Sp3"=13:18)
rownames(df1)=c("A","B","C","D","E","F")
df1
Sp1 Sp2 Sp3
A 1 7 13
B 2 8 14
C 3 9 15
D 4 10 16
E 5 11 17
F 6 12 18
df1
カットオフ値でフィルタリングしてrowSums(df1)
、ダウンストリーム分析に含めたいサイト (行名) を返します。
include<-rownames(df1[rowSums(df1)>=22,])
include
[1] "B" "C" "D" "E" "F"
私は2番目の data.frame を持っています:
df2<-data.frame(site.x=c("A","B","C"), site.y=c("D","E","F"),score=1:3)
site.x site.y score
1 A D 1
2 B E 2
3 C F 3
df2$site.x
「include」にリストされているサイトとdf2$site.y
正確に等しい行のみが含まれるようにdf2をフィルタリングしたい、つまり「A」を含む行を除外して返す。
site.x site.y score
2 B E 2
3 C F 3
私が試してみました :
filter<-df2$site.x == include & df2$site.y == include
filtered<-df2[filter,]
アドバイスをありがとう!
答え
で使用%
filter<-df2$site.x %in% include & df2$site.y =%in% include
filtered<-df2[filter,]
filtered
site.x site.y score
2 B E 2
3 C F 3