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更新だから私はこのような何千もの線を持つテキスタイルを持っています

BRCA A2ML1 Missense_Mutation TCsA-A1-A0SO A8K2U0 W408C

BRCA A2ML1 Missense_Mutation TCsA-A8-A08P A8K2U0 R433H

BRCA A2ML1 Missense_Mutation TCsA-B6-A0WZ A8K2U0 P1341L

行全体と 6 番目のトークンのみをキャプチャするコードを作成しました (以下のコード)。現在、6 番目のトークンを独自の行に一致させようとしています。

出力として取得したいのは、次のような出力ファイルを書き込もうとしているということです (これはほんの一例です)

A8K2U0 |START=1 END.....| R433H |BRCA A2ML1 Missense_Mutation TCsA-A8-A08P A8K2U0 R433H

他の行と同じ

A8K2U0 |START=1 END.....| P1341L |BRCA A2ML1 Missense_Mutation TCsA-B6-A0WZ A8K2U0 P1341L

辞書のコードは次のとおりです。

lookup = defaultdict(list) 
wholelookup = defaultdict(list)
wholeline = defaultdict(list)
mydata = open('file.txt')

for line in csv.reader(mydata, delimiter='\t'):
    code = re.match('[a-z](\d+)[a-z]', line[-1], re.I)
    if code:      
       lookup[line[-2]].append(code.group(1))
       wholelookup[line[-2]].append(code.group(0))
       s=' '.join(line)
       wholeline[line[-2]].append(s)
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A177T質問 if ステートメントを使用して、 が inかどうかを確認するにはどうすればよいCOADREAD ZNF271 Missense_Mutation MAAA-AA-3947 Q14591 A177Tですか?

自明：

test_string = 'A177T'
to_search = 'COADREAD ZNF271 Missense_Mutation MAAA-AA-3947 Q14591 A177T'
if test_string in to_search:
    print "found", test_string

または、DSM のアドバイス:

test_string = 'A177T'
to_search = 'COADREAD ZNF271 Missense_Mutation MAAA-AA-3947 Q14591 A177T'
if test_string in to_search.split(' '):
    print "found", test_string

しかし、私はその質問を誤解しているとはっきりと感じています。

于 2012-07-24T19:05:07.170 に答える