1

Ubunto や Perl については知りませんが、プログラムをインストールして実行する必要があります。これは私が見ているものです: http://vcftools.sourceforge.net/docs.html

インストールセクションでは、次のように述べています。

vcftools 実行可能ファイルをビルドするには、vcftools フォルダーに「make」と入力します。

Perl スクリプトでは、VCF ファイルが bgzip で圧縮され、tabix でインデックスが作成されている必要があります (どちらのツールも tabix パッケージに含まれており、ここからダウンロードできます)。どちらのツールも、PATH 環境変数にリストされているディレクトリーにある必要があります。Perl スクリプトを実行するには、PERL5LIB 環境変数を設定して、Vcf.pm モジュールを含める必要があります。

export PERL5LIB=/path/to/your/installation/perl

わかりました、VCFtoolsフォルダーを抽出してubuntuのホームフォルダーにコピーしました。次に、「make」と言ってエラーが発生したので、そのtabidxツールをダウンロードしましたが、この時点から、どうすればよいかわかりません。わかりましたtabidxをダウンロードしますが、次に何をどのように行うべきですか?

ありがとう。

4

1 に答える 1

2
find / -name Vcf.pm

それが 1 行しかない場合は、次のようにすることができます。

export PERL5LIB=$( dirname $( find . -name Vcf.pm ))
于 2012-07-31T17:59:04.963 に答える