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私はこれをグーグルで検索しましたが、このためのelispスクリプトが見つかりません。時々、空白のクリーンアップを実行してから、diff-buffer-with-fileを実行して、空白のクリーンアップが何を実行したかを確認します。
すべてのdiffモードバッファで空白モードを有効にする場合:
(add-hook 'diff-mode-hook '(lambda () (whitespace-mode 1)))