私はWekaが初めてです。
API を使用して WEKA を実行しようとしていますが、WEKA GUI の結果が Java コードによって生成された結果と一致しないことがわかりました。
TrainingSet と Test Set を提供して、RandomForest アルゴリズムを実行しようとしています。
コード スニペットは次のとおりです。
DataSource ds = new DataSource(trainingFile);
Instances insts = ds.getDataSet();
insts.setClassIndex(insts.numAttributes() - 1);
Classifier cl = new RandomForest();
RandomForest rf = (RandomForest)cl;
// rf.setOptions(options);
// rf.setNumExecutionSlots(1);
rf.setNumFeatures(5);
rf.setSeed(1);
rf.setNumExecutionSlots(1);
Remove remove = new Remove();
int[] attrs = WekaCustomisation.convertIntegers(attrList);
remove.setAttributeIndicesArray(attrs);
remove.setInvertSelection(true);
remove.setInputFormat(insts);
insts = weka.filters.Filter.useFilter(insts, remove);
insts.setClassIndex(insts.numAttributes() - 1);
weka.core.Instances train = new weka.core.Instances(insts, 0, insts.numInstances());
cl.buildClassifier(train);
weka.core.converters.ConverterUtils.DataSource ds2 = new weka.core.converters.ConverterUtils.DataSource(testFile);
weka.core.Instances instsTest = ds2.getDataSet();
remove.setInputFormat(instsTest);
instsTest = weka.filters.Filter.useFilter(instsTest, remove);
instsTest.setClassIndex(instsTest.numAttributes() - 1);
Instances testInstances = new Instances(instsTest);
int numCorrect = 0;
weka.classifiers.Evaluation eval = new weka.classifiers.Evaluation(train);
eval.evaluateModel(cl, testInstances);
System.out.println(eval.toSummaryString());
out.write(eval.toSummaryString());
double roc = eval.areaUnderROC(0);
WEKA GUI とこのコードによって生成される混同行列は異なります。ここで何が欠けていますか。