Java の OS 用にエクスプローラーを設計しようとしています。これは、Windows での「マイ コンピュータ」のようなものです (明らかにいくつかの新機能を備えています)。以前に Swing を使用したことがあり、アニメーション プログラミングについて少し学ぶ必要があるかもしれません。誰かが始めるのに適した場所や資料を提案できますか??
また、基盤となるOSと通信する必要があります（そう信じています）。プラットフォームに依存しない言語では、基盤となるOS機能を使用することは想定されていないため、Javaでこれを行うにはどうすればよいですか!!
まず、Javaは、このタスクに適したプログラミング言語ではありません。これは、（ご指摘のとおり）基盤となるOS機能へのアクセスには適していないためです。ただし、単にファイルシステムにアクセスする必要がある場合は、Java7ファイルシステムAPIが必要なものを提供する場合があります。
次に、この「エクスプローラー」でWebブラウザーを使い果たしたい場合は、信頼できるブラウザープラグインとして、おそらくCまたはC++で記述する必要があります。
第三に、クールなアニメーション効果について考える前に、基本的な機能を取得する必要があります。
最後に、あなたはおそらく車輪の再発明をしているでしょう。