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Python と、場合によっては networkx を使用して、異なる色のオーバーレイ サブグラフを使用してグラフを作成できるかどうか疑問に思っています。これらのサブグラフはノードのクラスターです。このようなグラフの例は、次の場所にあります。
http://www.barabasilab.com/pubs/CCNR-ALB_Publications/200904-10_PLoSCompBio-HumanPhenotypes/200904-10_PLoSCompBio-Fig2sm.png