cPickleとプロトコルバージョン2を使用して、いくつかの計算結果をダンプしました。コードは次のようになります。
> f = open('foo.pck', 'w')
> cPickle.dump(var, f, protocol=2)
> f.close()
変数varは、長さが2のタプルです。var [0]のタイプはリストであり、var[1]はnumpy.ndarrayです。
上記のコードセグメントは、大きなサイズ(〜1.7G)のファイルを正常に生成しました。
しかし、foo.pckから変数を読み込もうとすると、次のエラーが発生しました。
ValueError Traceback (most recent call last)
/home/user_account/tmp/<ipython-input-3-fd3ecce18dcd> in <module>()
----> 1 v = cPickle.load(f)
ValueError: buffer size does not match array size
読み込みコードは次のようになります。
> f= open('foo.pck', 'r')
> v = cPickle.load(f)
また、(cPickleの代わりに)pickleを使用して変数をロードしようとしましたが、次のような同様のエラーメッセージが表示されました。
ValueError Traceback (most recent call last)
/home/user_account/tmp/<ipython-input-3-aa6586c8e4bf> in <module>()
----> 1 v = pickle.load(f)
/usr/lib64/python2.6/pickle.pyc in load(file)
1368
1369 def load(file):
-> 1370 return Unpickler(file).load()
1371
1372 def loads(str):
/usr/lib64/python2.6/pickle.pyc in load(self)
856 while 1:
857 key = read(1)
--> 858 dispatch[key](self)
859 except _Stop, stopinst:
860 return stopinst.value
/usr/lib64/python2.6/pickle.pyc in load_build(self)
1215 setstate = getattr(inst, "__setstate__", None)
1216 if setstate:
-> 1217 setstate(state)
1218 return
1219 slotstate = None
ValueError: buffer size does not match array size
同じコードセグメントをはるかに小さいサイズのデータで試しましたが、正常に機能しました。ですから、私の一番の推測は、ピクルス(またはcPickle)のロードサイズの制限に達したということです。ただし、(大きなサイズの変数を使用して)正常にダンプするのは奇妙ですが、ロードに失敗しました。
これが実際に読み込みサイズの制限の問題である場合、どのようにバイパスする必要がありますか?そうでない場合、問題の考えられる原因は何でしょうか?
任意の提案をいただければ幸いです。ありがとう!