c# - MSBuild が Path プロパティと一致しないのはなぜですか?

Question

カスタム アセンブリへの参照があります。アセンブリのプロパティを見ると、

Path = C:\Windows\Microsoft.Net\assembly\GAC_32\Assembly.Namespace\v4.0_3.0.0.0__c199d42a01e99449\Assembly.Namespace.dll

.cs プロジェクトの MSBuild を見ると、

<Reference Include="Assembly.Namespace, Version=2.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=c199d42a01f89449, processorArchitecture=x86">
  <SpecificVersion>False</SpecificVersion>
  <HintPath>..\..\Project DLLs\Folder Name\Assembly.Namespace.dll</HintPath>
</Reference>

パスが一致しません。また、.NET ランタイムのバージョンが一致していないようです。Csc.exeを使用する Visual Studio でプロジェクトをビルドすると、動作します。MSBuildを使用する FinalBuilder を使用すると、ビルドが壊れます。