私はEclipse Mavenプロジェクトで標準のMavenディレクトリレイアウトを利用しています: src/main/java src/main/assembly src/main/config src/main/scripts src/main/resources src/test/java src/test/resources
に従って：http://maven.apache.org/guides/introduction/introduction-to-the-standard-directory-layout.html
その後、m2e プラグインで「Maven -> Update Project Configuration」を使用すると、「assembly」、「config」、および「scripts」ディレクトリが m2e によってソース フォルダーから削除されます。標準のMavenレイアウトを尊重するようにm2eを構成する方法を誰かが提案していただければ幸いです。プロジェクトの作成には、m2e が提供する基本的な Java アーキタイプを使用しました。