IntelのMKLライブラリを使用してNumpyを構築しました(私にとっては難しいプロセスでした。1日かかりました!)。NumpyはLD_LIBRARY_PATH環境変数を使用してMKLライブラリにリンクする必要があります。または、少なくともこれが私のやり方です...したがって、.bashrcでexportを使用してパスを保存し、新しいコンソールを起動してpythonを実行すると、 Numpyはライブラリとともに正しくロードされます。
問題は、プログラムの開発にPydevで使用しているEclipseでは機能しないことです。Eclipseの設定のどこかにLD_LIBRARY_PATHを追加することはできますが、Scipyをインストールしようとすると問題が現実になります。ScipyのインストールスクリプトはNumpyをインポートする必要があり、LD_LIBRARY_PATHが正しく設定されている場合でも、インポートできないMKLライブラリでエラーが発生します。
$ sudo python setup.py install
Traceback (most recent call last):
File "setup.py", line 208, in <module>
setup_package()
File "setup.py", line 145, in setup_package
from numpy.distutils.core import setup
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
import add_newdocs
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
from type_check import *
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
import multiarray
ImportError: libimf.so: cannot open shared object file: No such file or directory
libimf.soは、リンクする必要のあるMKLの共有ライブラリの1つです。Numpyのファイルを直接変更することを除けば__init__.py
(それを行うためのよりクリーンな方法があるかもしれないので、私はむしろ避けます)、NumpyをMKLライブラリに永続的にリンクするために何をすべきかわかりません。
ご協力いただきありがとうございます!