matlab - RまたはMATLABの適合率-再現率曲線の下の領域

Question

バイナリターゲットのリストの予測スコアがあります。Rまたはmatlabを使用して適合率-再現率曲線の下の面積を計算するための最良の方法は何でしょうか？

これを検索しましたが、このタスクを実行するための関連する関数/ライブラリが見つかりませんでした。これは人々が行うかなり一般的なことであるはずなので、それは奇妙に思えます。私が何かを逃したかどうかはわかりません。どんな助けでもいただければ幸いです。

Answer 1

以下はmatlabの実現です

function auc = scoreAUC(category,posterior)
% auc = scoreAUC(category,posterior)
%
% Calculates the area under the ROC for a given set
% of posterior predictions and labels. Currently limited to two classes.
%
% posterior: n1 matrix of posterior probabilities for class 1
% category: n1 matrix of categories {0,1}
% auc: Area under the curve
%
% Author: Benjamin Hamner
% Date Modified: October 14, 2010
%
% Algorithm found in
% A Simple Generalisation of the Area Under the ROC
% Curve for Multiple Class Classification Problems
% David Hand and Robert Till
% http://www.springerlink.com/content/nn141j42838n7u21/fulltext.pdf

r = tiedrank(posterior);
auc = (sum(r(category==1)) - sum(category==1) * (sum(category==1)+1)/2) / ...
( sum(category<1) * sum(category==1));