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次のコードを使用しています。

#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include <stdlib.h>

int main(void)
{   
 int two=0, two2 = 0;
 int cast11, cast12,c1157,c1257;
 static const char filename[] = "clearedacg_filter.txt";
 static const char filename2[] = "FinalVariantReferenceTable_FilterHomVarArcLiverDR_sorted.txt";
 char* chrarray[22] = {"chr1","chr2","chr3","chr4","chr5","chr6","chr7","chr8","chr9","chr10","chr11","chr12","chr13","chr14","chr15","chr16","chr17","chr18","chr19","chrX","chrY","chrM"};    
 FILE *file3 = fopen("AllSNPcounts_filter.txt","w");
 FILE *file4 = fopen("AllSNPcounts_nonhits.txt","w");
 char word[3];
 char temp[] = "chr1";
 char* dp4 = "DP4";
 FILE *file = fopen(filename, "r");
 unsigned int i,j,k,sum;
 int count = 0;
 int dp4_field = 0;

 FILE *file2;
 file2 = fopen(filename2, "r");
 if ( file != NULL )
 {
  char line[BUFSIZ],line2[BUFSIZ];
  char one[20], three[22], five[100], four[20], four2[20], one2[20], three2[22], five2[100], six[20], six2[20], seven[20], seven2[20];

  fgets(line, sizeof line, file); 
  fgets(line2, sizeof line2, file2);

  while(1)
  {  
   sscanf(line, "%19s %21s %*s %19s %19s %19s %*s %99s", one, three, four, six, seven, five);
   two = atoi(three);
   sscanf(line2, "%19s %21s %*s %19s %19s %19s", one2, three2, four2, six2, seven2);
   two2 = atoi(three2);
   if(!strcmp(temp,one))
   {
    if(!strcmp(temp,one2))
    {
     if(two == two2)
     {
      dp4_field = 0; 
      for(i=5; i < strlen(five);i++)
      {
       sum = 0;
       for(j=i,k=0; k<3;j++,k++)
       {
        *(word+k) = five[j];
       }
       if(strcmp(word,dp4) == 0)
       {
        dp4_field = 1;
        sscanf(five+4+i, "%d,%d,%d,%d",&cast11 , &cast12, &c1157, &c1257);
       }

      }
      if(dp4_field)
      {
       printf("%s\t%s\t%d\t%d\t%s\t%s\t%s\t%s\t%s\t%s\t\n", one2, three2, cast11+cast12, c1157+c1257, four, six, seven, four2, six2 , seven2);
       fprintf( file3,"%s\t%s\t%d\t%d\t%s\t%s\t%s\t%s\t%s\t%s\t\n", one2, three2, cast11+cast12, c1157+c1257, four, six, seven, four2, six2 , seven2);
      }
      if(fgets(line2, sizeof line2, file2) == NULL)
       break;
      if(fgets(line, sizeof line, file) == NULL)
       break;
     }

     else if(two > two2)
     {
      fprintf( file4,"%s\t \n", line2);
      if(fgets(line2, sizeof line2, file2) == NULL)
       break;
     }

     else 
     {
      if(fgets(line, sizeof line, file) == NULL)
       break;
     }

    }
    else
    {
     count++;
     strcpy(temp,chrarray[count]);
     while(strcmp(temp,one))
     {
      if(fgets(line, sizeof line, file) == NULL)
       break;

      sscanf(line, "%19s %21s %*s %19s %19s %19s %*s %99s", one, three, four, six, seven, five);
     }
    }
   }
   else
   {
    count++;
    strcpy(temp,chrarray[count]);
    while(strcmp(temp,one2))
    {
     if(fgets(line2, sizeof line2, file2) == NULL)
      break;
     fprintf( file4,"%s\t \n", line2);
     sscanf(line2, "%19s %21s %*s %19s %19s %19s %*s %99s", one2, three2, four2, six2, seven2, five2);  
    }
   }
  }
  fclose(file);
  fclose(file2);
  fclose(file3);
  fclose(file4);
 }
 else
 {
  perror(filename);
 }
 return 0;

}

私はコンソールとこのコードのファイルに印刷しています。コンソールには問題なく表示されますが、ファイルへの出力中に 20 ～ 40 行などの最後の数行がスキップされます。ここで問題がわかりませんでした。

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1 に答える 1

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fclose下部にある一連の呼び出しを実行せずにプログラムを終了しているように見える単純なバグがあります。出力を明示的にフラッシュすることはないため、通常は最後にファイル ストリームを閉じるときに最終的なバッファリングされたコンテンツのみをフラッシュしますが、プログラムが失敗した (またはハングした) 場合、それらは呼び出されません。

コンソール出力は、改行ごとに自動的にフラッシュされるようです (通常)。したがって、それらの違い。

もちろん、本当の問題はフラッシュの欠如ではなく、プログラムが失敗したりハングしたりする原因となるバグです。これが宿題やテストの問題ではなく、真剣にコーディングしたものである場合は、何が問題なのかを突き止めたり、デバッグして解決したりできるはずです。私はあなたのためにその部分をしません。;)

追加:しかし、ヒントを与えます: 配列は有限であり、それらの末尾を超えてアクセスすると、悪いことが起こりがちです。

于 2012-09-13T19:30:36.890 に答える