関数 を使用する matlab コードを実行しようとしています。これは、fastaread不足しているバイオインフォマティクス ツールボックスで利用できます。.fastaこのコードを実行するために、ファイル関数からデータを読み取る独自の関数を作成できるかどうか疑問に思っています。
このような漠然とした素朴な質問で申し訳ありません。しかし、どんな助けも本当に感謝しています。前もって感謝します。
ご回答ありがとうございます。readfasta.m の名前を mbetoolbox から fastaread.m に変更しました。ただし、次のエラーが発生します。
??? Error: File: /home/users/fastaread.m Line: 85 Column: 1
Expression or statement is incorrect--possibly unbalanced (, {, or [.
Error in ==> calculate_cons>read_alignment_fasta at 111
full_alignment = fastaread(msa_fasta_filename);
Error in ==> calculate_cons>read_alignment at 67
[encoded_focus_alignment, focus_index_of_interest, focus_to_uniprot_offset_map]
= read_alignment_fasta(msa_fasta_filename, seqid_of_interest);
Error in ==> calculate_cons at 41
[Pij_true, Pi_true, alignment_width, q, encoded_seq_of_interest,
focus_to_uniprot_offset_map] = read_alignment(msa_fasta_filename,
seqid_of_interest, theta);
ご親切に助けていただければ幸いです。前もって感謝します。