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接尾辞配列部分を開発する方法のヒントを誰かに教えてもらえますか？私はその概念を知っています。LCPアレイの設計ですが、Cで実装する方法がわかりませんか？誰か助けてもらえますか？私はそれについてたくさん読んだので、接尾辞配列の使用法、アルゴリズムを知っています。文字列のサフィックスを並べ替える必要がある部分の実装ヒントが必要です。

たとえば、文字列が「banana」として指定されている場合、次のようになります。

データ構造は次のようになります：（$->ニーモニック）

banana
anana
nana
ana
na
a
$

次に、それを保持した後、それをソートする必要があります。つまり、最も低いサブストリングが最も上のポイントにある必要があります。それで、それをどのように行うのですか？文字列は長くすることができます。このことを行う方法は？ヒントやリンクを教えていただけますか？私はあなたの助けを借りて試してみました。

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この記事の最後に、次のサフィックス ツリーの実装があります。

注:次のコードは C++ ですが、new[] および delete[] 演算子を C のようなヒープ割り当てに置き換えると、非常に簡単に再利用できます。

inline bool leq(int a1, int a2,   int b1, int b2) { // lexic. order for pairs
  return(a1 < b1 || a1 == b1 && a2 <= b2); 
}                                                   // and triples
inline bool leq(int a1, int a2, int a3,   int b1, int b2, int b3) {
  return(a1 < b1 || a1 == b1 && leq(a2,a3, b2,b3)); 
}
// stably sort a[0..n-1] to b[0..n-1] with keys in 0..K from r
static void radixPass(int* a, int* b, int* r, int n, int K) 
{ // count occurrences
  int* c = new int[K + 1];                          // counter array
  for (int i = 0;  i <= K;  i++) c[i] = 0;         // reset counters
  for (int i = 0;  i < n;  i++) c[r[a[i]]]++;    // count occurences
  for (int i = 0, sum = 0;  i <= K;  i++) { // exclusive prefix sums
     int t = c[i];  c[i] = sum;  sum += t;
  }
  for (int i = 0;  i < n;  i++) b[c[r[a[i]]]++] = a[i];      // sort
  delete [] c;
}

// find the suffix array SA of s[0..n-1] in {1..K}^n
// require s[n]=s[n+1]=s[n+2]=0, n>=2
void suffixArray(int* s, int* SA, int n, int K) {
  int n0=(n+2)/3, n1=(n+1)/3, n2=n/3, n02=n0+n2; 
  int* s12  = new int[n02 + 3];  s12[n02]= s12[n02+1]= s12[n02+2]=0; 
  int* SA12 = new int[n02 + 3]; SA12[n02]=SA12[n02+1]=SA12[n02+2]=0;
  int* s0   = new int[n0];
  int* SA0  = new int[n0];

  // generate positions of mod 1 and mod  2 suffixes
  // the "+(n0-n1)" adds a dummy mod 1 suffix if n%3 == 1
  for (int i=0, j=0;  i < n+(n0-n1);  i++) if (i%3 != 0) s12[j++] = i;

  // lsb radix sort the mod 1 and mod 2 triples
  radixPass(s12 , SA12, s+2, n02, K);
  radixPass(SA12, s12 , s+1, n02, K);  
  radixPass(s12 , SA12, s  , n02, K);

  // find lexicographic names of triples
  int name = 0, c0 = -1, c1 = -1, c2 = -1;
  for (int i = 0;  i < n02;  i++) {
    if (s[SA12[i]] != c0 || s[SA12[i]+1] != c1 || s[SA12[i]+2] != c2) { 
      name++;  c0 = s[SA12[i]];  c1 = s[SA12[i]+1];  c2 = s[SA12[i]+2];
    }
    if (SA12[i] % 3 == 1) { s12[SA12[i]/3]      = name; } // left half
    else                  { s12[SA12[i]/3 + n0] = name; } // right half
  }

  // recurse if names are not yet unique
  if (name < n02) {
    suffixArray(s12, SA12, n02, name);
    // store unique names in s12 using the suffix array 
    for (int i = 0;  i < n02;  i++) s12[SA12[i]] = i + 1;
  } else // generate the suffix array of s12 directly
    for (int i = 0;  i < n02;  i++) SA12[s12[i] - 1] = i; 

  // stably sort the mod 0 suffixes from SA12 by their first character
  for (int i=0, j=0;  i < n02;  i++) if (SA12[i] < n0) s0[j++] = 3*SA12[i];
  radixPass(s0, SA0, s, n0, K);

  // merge sorted SA0 suffixes and sorted SA12 suffixes
  for (int p=0,  t=n0-n1,  k=0;  k < n;  k++) {
#define GetI() (SA12[t] < n0 ? SA12[t] * 3 + 1 : (SA12[t] - n0) * 3 + 2)
    int i = GetI(); // pos of current offset 12 suffix
    int j = SA0[p]; // pos of current offset 0  suffix
    if (SA12[t] < n0 ? 
        leq(s[i],       s12[SA12[t] + n0], s[j],       s12[j/3]) :
        leq(s[i],s[i+1],s12[SA12[t]-n0+1], s[j],s[j+1],s12[j/3+n0]))
    { // suffix from SA12 is smaller
      SA[k] = i;  t++;
      if (t == n02) { // done --- only SA0 suffixes left
        for (k++;  p < n0;  p++, k++) SA[k] = SA0[p];
      }
    } else { 
      SA[k] = j;  p++; 
      if (p == n0)  { // done --- only SA12 suffixes left
        for (k++;  t < n02;  t++, k++) SA[k] = GetI(); 
      }
    }  
  } 
  delete [] s12; delete [] SA12; delete [] SA0; delete [] s0; 
}
于 2012-11-14T15:13:33.857 に答える
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これはあなたを助けるかもしれません。

http://code.google.com/p/code-share/source/browse/trunk/cpp/algo/suffix_array/SuffixArray.h

#ifndef _SUFFIX_ARRAY_H
#define _SUFFIX_ARRAY_H

#include<algorithm>
#include<cstring>
#include <stdexcept>

using namespace std;
template<class T>
struct comp_func
{
    bool operator()(const T l,const T r)
    {
        return strcmp(l,r) < 0;

    }
};
template<class T =char>
class SuffixArray
{
    int len_;
    T **data_;

    public:
    T *operator[](int i)
    {
        if(i<0 || i>len_)
            throw std::out_of_range("Out of range error\n");
        return data_[i];
    }
    SuffixArray(T *str):len_(strlen(str)),data_(new T*[len_])
    {
        //len_ = strlen(str);
        //data_= new T*[len];
        for(int i =0;i<len_;++i)
        {
            data_[i] = &str[i];
            cout << data_[i] << endl;
        }
        std::sort(&data_[0],&data_[len_],comp_func<T *>());
    }
    void Print()
    {
        for(int i =0;i<len_;++i)
        {
            cout << data_[i] << endl;
        }

    }
};


#endif
于 2012-09-27T20:55:20.370 に答える