私は生存分析の教科書の例に従おうとしていますが、ここでどこが間違っているのかわかりません:
df1 <- as.data.frame( cbind(seq(1:5),c(6,44,21,14,62),c(1,1,0,1,1)) )
names(df1) <- c('subject','time','censor')
require(survival)
f1 <- survfit(Surv(time=time, event=censor) ~1, data=df1)
quantile(f1)
これにより、次のようになります。
Error in xi == xj : comparison of these types is not implemented
In addition: Warning messages:
1: In `[.survfit`(x, !nas) :Survfit object has only a single survival curve
2: In `[.survfit`(x, i) : Survfit object has only a single survival curve
3: In `[.survfit`(x, j) : Survfit object has only a single survival curve
複数の曲線を持つ survfit オブジェクトでこれを試しましたが、同じメッセージが表示されます...
「R バージョン 2.14.1 (2011-12-22)」
「x86_64-pc-linux-gnu」
search() からの出力:
[1] ".GlobalEnv" "package:km.ci" "package:survival"
[4] "package:splines" "package:stats" "package:graphics"
[7] "package:grDevices" "package:utils" "package:datasets"
[10] "package:methods" "Autoloads" "package:base"
どうもありがとう!
編集: DWin に感謝しhelp(Surv)
ます。
ただし、まだ同じエラーメッセージが表示されます。quantile.survfit {survival}
S3ジェネリックとして文書化されている:のヘルプを読んでいる
ので、使用quantile(f1)
するとこのメソッドが呼び出されるはずだと思っていました。
ただし、次の方法では機能しないことがわかりました。
survival:::quantile.survfit(f1)
与えます:
Error: 'quantile.survfit' is not an exported object from 'namespace:survival'
サバイバルを再インストールしようとしましたが、それはまだ最新バージョンです:survival_2.36-10