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EndNote によって作成された XML ファイルを R データ フレームに取得したいと考えています。

最後の子ノード (タイトル、作成者など) をそれぞれ列にしたい

EndNote xml ファイルの例は、以下から入手できます。

要旨の例

ライブラリ(XML)を使用してこれを解決する必要があります。誰かが既製の解決策を持っていることを願っています。これが怠惰に聞こえる場合は申し訳ありません。

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データフレームに変換する際にも同様の問題がありました。xmlToDataFrame子ノードで使用しました。

library(XML)
library(RCurl)
urldata<-"https://gist.github.com/raw/3831049/80f1315ba03d278b4f5f0d916fb1999709fc40e6/endnote.xml"
urldata<-xmlParse(getURL(urldata,ssl.verifypeer = FALSE,.opts=curlOptions(followlocation=TRUE)))
xmlToDataFrame(getNodeSet(urldata,'//*/record'))

#             database source-app rec-number foreign-keys ref-type
# 1 EndNote Ecology.enl    EndNote      13264        13264       17
# 2 EndNote Ecology.enl    EndNote      13265        13265       17
#        contributors                                  auth-address
# 1    Chapman, A. G. Cent States Forest Expt Stn, Columbus, OH USA
# 2 Strohecker, H. F.                 Univ Chicago, Chicago, IL USA
#                                                                                                     titles
# 1 An ecological basis for reforestation of submariginal lands in the Central Hardwood RegionEcologyEcology
# 2                                          A survey of soil temperatures in the Chicago areaEcologyEcology
#       periodical alt-periodical   pages volume number   dates      isbn
# 1 EcologyEcology EcologyEcology  93-105     18      1 1937Jan 0012-9658
# 2 EcologyEcology EcologyEcology 162-168     18      1 1937Jan 0012-9658
#         accession-num                                           notes
# 1 ISI:000200148800007  V02fg\rTimes Cited:5\rCited References Count:2
# 2 ISI:000200148800014 V02fg\rTimes Cited:5\rCited References Count:14
#                            urls language
# 1 <Go to ISI>://000200148800007  English
# 2 <Go to ISI>://000200148800014  English

一般的に使用する場合、複数の作成者 (ここでは発生しません) などに問題がある可能性があり、おそらくわずかな変更が必要になります。

于 2012-10-04T02:44:13.750 に答える