EndNote によって作成された XML ファイルを R データ フレームに取得したいと考えています。
最後の子ノード (タイトル、作成者など) をそれぞれ列にしたい
EndNote xml ファイルの例は、以下から入手できます。
ライブラリ(XML)を使用してこれを解決する必要があります。誰かが既製の解決策を持っていることを願っています。これが怠惰に聞こえる場合は申し訳ありません。
データフレームに変換する際にも同様の問題がありました。xmlToDataFrame
子ノードで使用しました。
library(XML)
library(RCurl)
urldata<-"https://gist.github.com/raw/3831049/80f1315ba03d278b4f5f0d916fb1999709fc40e6/endnote.xml"
urldata<-xmlParse(getURL(urldata,ssl.verifypeer = FALSE,.opts=curlOptions(followlocation=TRUE)))
xmlToDataFrame(getNodeSet(urldata,'//*/record'))
# database source-app rec-number foreign-keys ref-type
# 1 EndNote Ecology.enl EndNote 13264 13264 17
# 2 EndNote Ecology.enl EndNote 13265 13265 17
# contributors auth-address
# 1 Chapman, A. G. Cent States Forest Expt Stn, Columbus, OH USA
# 2 Strohecker, H. F. Univ Chicago, Chicago, IL USA
# titles
# 1 An ecological basis for reforestation of submariginal lands in the Central Hardwood RegionEcologyEcology
# 2 A survey of soil temperatures in the Chicago areaEcologyEcology
# periodical alt-periodical pages volume number dates isbn
# 1 EcologyEcology EcologyEcology 93-105 18 1 1937Jan 0012-9658
# 2 EcologyEcology EcologyEcology 162-168 18 1 1937Jan 0012-9658
# accession-num notes
# 1 ISI:000200148800007 V02fg\rTimes Cited:5\rCited References Count:2
# 2 ISI:000200148800014 V02fg\rTimes Cited:5\rCited References Count:14
# urls language
# 1 <Go to ISI>://000200148800007 English
# 2 <Go to ISI>://000200148800014 English
一般的に使用する場合、複数の作成者 (ここでは発生しません) などに問題がある可能性があり、おそらくわずかな変更が必要になります。