いくつかのファイルからいくつかの情報を抽出して別のファイルに渡すスクリプトを Python で作成しています。
クラスの要素のリストを含む 2 つの辞書があり、リストの各要素を .csv ファイルに書き込みたいと考えています。
ファイルにデータを書き込もうとすると、奇妙な方法で表示されます。データを次のように表示したい:
Sample_3 45526536 7010285 31195850 7320401 45500691 7186449 31021951 7292291
Sample_1 48885783 7715654 33474067 7696062 48857972 7907873 33282945 7667154
しかし、代わりに次の結果が得られました。
Sample_3 ['45526536'] ['7010285'] ['31195850'] ['7320401'] ['45500691'] ['7186449'] ['31021951'] ['7292291']
Sample_1 ['48885783'] ['7715654'] ['33474067'] ['7696062'] ['48857972'] ['7907873'] ['33282945']['7667154']
数字に [´´] を追加する理由を知っている人はいますか? [' '] を削除するための非常に簡単な方法を作成しようとしましたが、ファイルに何も出力しません。
def correct_str(value):
new= str(value).strip("['")
final= str(new).strip("']")
return final
ディクショナリに要素を追加するコードは次のとおりです。ディクショナリは stat_dict_l_u というグローバル変数で、名前はディクショナリのキーです。この場合、Sample_1 と Sample_2 です。リストの値は、数値を含むリストです。ファイルから取得しました。おそらく私の問題は、辞書に値を追加する方法にあると思います。
def processNumbersLeft(name,list_values):
list_reads=[]
for value in list_values:
print value.total_reads
list_reads.append(value.total_reads)
list_aligned_once=[]
for value in list_values:
n=re.split(" ",value.aligned_once)
list_aligned_once.append(n[0])
list_failed=[]
for value in list_values:
n=re.split(" ",value.failed)
list_failed.append(n[0])
list_aligned_several=[]
for value in list_values:
n=re.split(" ",value.aligned_several)
list_aligned_several.append(n[0])
stat_elem=Statistics(list_reads,list_aligned_once,list_failed,list_aligned_several)
stat_dict_l_u[name]=stat_elem
ありがとうございました!