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クラスタリングアルゴリズムを特にタンパク質間相互作用(PPI)ネットワークに適用したいと思います。そのためには、結果を検証できるように、参照を含むベンチマークデータセットが必要です。どんな提案も大いに評価できるでしょう。

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van Brohee と van Helden によるタンパク質間相互作用ネットワークのクラスタリング アルゴリズムの評価( http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17087821 )を読むことをお勧めします。彼らのベンチマーク データは利用可能であり、クラスタリング アルゴリズムやゴールド スタンダードを比較する際に存在する多くの落とし穴をうまく回避しています。

于 2012-10-22T08:28:01.940 に答える