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65,000 x 160 の行列があり、R で image(X) を使用して画像に変換します。

オプション useRaster = TRUE も使用します。これにより、プロットが大幅に高速になり、ファイルのサイズが小さくなります。

ただし、ファイル サイズは依然としてかなり大きく、～ 60 Mb です。Rで画像のファイルサイズを制御する方法はありますか? もしそうなら、ファイルサイズを制限することによって失われる解像度とその方法を知りたい.

このファイルは、次のコードの pdf ファイルとして作成されます。

# ----- Define a function for plotting a matrix ----- #
myImagePlot <- function(x, filename, ...){
  dev = "pdf"
  #filename = '/home/dnaiel/test.pdf'
  if(dev == "pdf") { pdf(filename, version = "1.4") } else{}
     min <- min(x)
     max <- max(x)
     yLabels <- rownames(x)
     xLabels <- colnames(x)
     title <-c()
  # check for additional function arguments
  if( length(list(...)) ){
    Lst <- list(...)
    if( !is.null(Lst$zlim) ){
       min <- Lst$zlim[1]
       max <- Lst$zlim[2]
    }
    if( !is.null(Lst$yLabels) ){
       yLabels <- c(Lst$yLabels)
    }
    if( !is.null(Lst$xLabels) ){
       xLabels <- c(Lst$xLabels)
    }
    if( !is.null(Lst$title) ){
       title <- Lst$title
    }
  }
# check for null values
if( is.null(xLabels) ){
   xLabels <- c(1:ncol(x))
}
if( is.null(yLabels) ){
   yLabels <- c(1:nrow(x))
}

layout(matrix(data=c(1,2), nrow=1, ncol=2), widths=c(4,1), heights=c(1,1))

 # Red and green range from 0 to 1 while Blue ranges from 1 to 0
 ColorRamp <- rgb( seq(0,1,length=256),  # Red
                   seq(0,1,length=256),  # Green
                   seq(1,0,length=256))  # Blue
 ColorLevels <- seq(min, max, length=length(ColorRamp))

 # Reverse Y axis
 reverse <- nrow(x) : 1
 yLabels <- yLabels[reverse]
 x <- x[reverse,]

 # Data Map
 par(mar = c(3,5,2.5,2))
 image(1:length(xLabels), 1:length(yLabels), t(x), col=ColorRamp, xlab="",
 ylab="", axes=FALSE, zlim=c(min,max), useRaster=TRUE)
 if( !is.null(title) ){
    title(main=title)
 }
# Here we define the axis, left of the plot, clustering trees....
#axis(BELOW<-1, at=1:length(xLabels), labels=xLabels, cex.axis=0.7)
# axis(LEFT <-2, at=1:length(yLabels), labels=yLabels, las= HORIZONTAL<-1,
# cex.axis=0.7)

 # Color Scale (right side of the image plot)
 par(mar = c(3,2.5,2.5,2))
 image(1, ColorLevels,
      matrix(data=ColorLevels, ncol=length(ColorLevels),nrow=1),
      col=ColorRamp,
      xlab="",ylab="",
      xaxt="n", useRaster=TRUE)

 layout(1)
  if( dev == "pdf") {
    dev.off() }
}
# ----- END plot function ----- #

ありがとう！

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そのようなマトリックスを作成し、そのデバイスのデフォルトサイズで呼び出しimage内を使用してプロットするjpegと、KB（90KB）で測定されたファイルを取得します。

> bigm <-matrix(sample(1:8, 65000*160, repl=TRUE),  160, 65000)
> jpeg(filename="test.jpg")
> image(bigm)
> dev.off()
quartz 
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これがアプリケーションに適しているかどうかは、おそらくこのタスクの正確な性質とOSの両方に依存しますが、どちらもまだ指定されていません。

于 2012-10-23T02:32:27.460 に答える