Aggregation Frameworkのグループ化機能を使用して$max、各 の最新のドキュメントを見つけることができますgroup_id。グループ化された条件に基づいて完全なドキュメントを取得するには、追加のクエリが必要です。
var results = new Array();
db.groups.aggregate(
    // Find documents with latest date for each group_id
    { $group: {
        _id: '$group_id',
        date: { $max: '$date' },
    }},
    // Rename _id to group_id, so can use as find criteria
    { $project: {
        _id: 0,
        group_id:'$_id',
        date: '$date'
    }}
).result.forEach(function(match) {
    // Find matching documents per group and push onto results array
    results.push(db.groups.findOne(match));
});
結果の例:
{
    "_id" : ObjectId("5096cfb8c24a6fd1a8b68551"),
    "group_id" : 1,
    "date" : ISODate("2012-11-03T00:00:00Z"),
    "foo" : "bar"
}
{
    "_id" : ObjectId("5096cfccc24a6fd1a8b68552"),
    "group_id" : 2,
    "date" : ISODate("2012-11-01T00:00:00Z"),
    "foo" : "baz"
}
{
    "_id" : ObjectId("5096cfddc24a6fd1a8b68553"),
    "group_id" : 3,
    "date" : ISODate("2012-11-03T00:00:00Z"),
    "foo" : "bat"
}