AMOScmpを使ってilluminaのペアエンドデータを解析したい。AMOScmp は、.afg ファイルを構築するために同数のペア ファイルを必要とします。元の fq ファイルがペアになっています。fq ファイルを品質、重複シーケンス、およびヒト DNA コントロールに個別に渡した後、対になった end fa ファイルの読み取り数が異なることがわかりました。ペアエンドリードからペアになっていないリードを削除して、同じ数のリードを持つ 2 つの fa ファイルを取得したいと考えています。問題の解決に役立つスクリプトやソフトウェアを知っている人はいますか?
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