numpy と matplot をインストールし、python 2.7 で正常に動作していますが、pip を使用して scipy をインストールすると、このエラーが発生します。
numpy.distutils.npy_pkg_config.PkgNotFound: Could not find file(s) ['/usr/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/lib/npy-pkg-config/npymath.ini']
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Command python setup.py egg_info failed with error code 1 in /var/folders/61/dpn0d5p51z19g5vypnmh3vfh0000gn/T/pip-build/scipy
Mac OS X に numpy、scipy、および matplotlib をインストールしようとするときに遭遇する可能性のある悲しみの量に終わりはありません。最先端に留まりたい場合は、git リポジトリをダウンロードして、それぞれをビルドすることをお勧めします。
最先端にいる必要がない場合は、SciPy Web サイトの指示に従ってください。
http://www.scipy.org/Installing_SciPy/Mac_OS_X
最後に、Chris Fonnesbeck の素晴らしい作品があります: https://github.com/fonnesbeck/ScipySuperpack
フォネスベック法は、私にとって失敗したことがありません。
また、pipを使用してscipyをインストールできませんでした。ただし、私にとってうまくいったオプションは、 scipy.org が提供する.dmg パッケージを使用することでした。
重要: Mac OS の Python を最新バージョンに更新する必要があります。つまり、引き続き Python 2.7 を使用できますが、python.org でダウンロードできる最新のビルドに更新する必要があります。
Mas OS X用のパッケージマネージャー（macportsなど）を使用することをお勧めします。このようなシステムの一種を使用すると、依存関係を手動で解決するなどの作業を回避できます。