私は次のようにC#でメソッドを呼び出しています:
return Chart.RenderChartHTML("../../Charts/MSLine.swf");
重要なのは、RenderChartHTMLを呼び出しているフォルダーによってパスが異なる可能性があるということです。
絶対パスを見つけても機能しないように、次のことを試しました。
string mslinepath = HttpContext.Current.Server.MapPath("~/Charts/MSLine.swf");
return Chart.RenderChartHTML(mslinepath);